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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001313`

染色体: Chr07 坐标: 10106138-10109217 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001313`
名称	SmilChr07G001313
描述	rho guanine nucleotide exchange factor 8-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10106138 - 10109217 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992477`
GeneID	`130992477`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992477`
原始查询	`LOC130992477`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rho guanine nucleotide exchange factor 8-like
产物	rho guanine nucleotide exchange factor 8-like
Arabidopsis	`AT3G24620` (ROPGEF8) RHO guanyl-nucleotide exchange factor 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822058] identity=61.6; qcov=0.81; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0272300` (Os) - identity=61.1; qcov=0.765; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF03759 (PRONE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992477

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057773110.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057773110.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057773110.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773110.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773110.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10106691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,D10,D11
`Chr7:10106802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B69,D11
`Chr7:10107969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B4
`Chr7:10107977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:10107983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B48,C87
`Chr7:10108607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B79,C60
`Chr7:10108614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B79
`Chr7:10108743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr7:10108801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773110.1

591 aa

296

591

PRONE

PF03759 PRONE 147-494 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773110.1`	Pfam	`PF03759`	PRONE	Family	147	494	9.1e-168	558.5	PRONE (Plant-specific Rop nucleotide exchanger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917127.1
GGATAGAAAAACAGCATTCCCTTCGCCATTCCCAAAAACAAGAAACCAACGTCCAATTCTTTCATTCCCCCAGGCAGCATGCACCCCACATTCCTCCAACATTGATTTCATGCTTCATCAAAACTAAACACCCCCAATTTTTCCTAGAAAACCAATCCTTTGTAGTCTGTTTCATAGCTCCTTGTTTGGAAAGGGGAATGTTGTTAGATTCGAAATGAGGCATTGAGGTAGAGCCACAATAATGGTTAAAGCAATGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992477
ATGGTTAAAGCAATGGAGGAGGCTGAAGATCAAGAGAGTTCGAGATCATCGAGGCTAGGGCGGTTCAGGGGCATGCTCGAGAGTGGCGCCAGCAAGTTTCGGCGCAGCCTCAACGACAACAACACCACCACCAATGGATCAGCCTCGCCCTTACCCTCGGACGAGGACAACGAGAGGATGACGGCCAAGAGCAACGCCTCCGCCCCCTTGCCCGAAGAGCCTGCTCCGCCCCCCGTCCAGCTCACCAAGCTAGGCGGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773110.1
MVKAMEEAEDQESSRSSRLGRFRGMLESGASKFRRSLNDNNTTTNGSASPLPSDEDNERMTAKSNASAPLPEEPAPPPVQLTKLGGILSRTENVKMNRTSSDGTPTPASAPATLPATTPSPTPAPTPKTSEAPPPSPPPPVRKMPTDMDLMKEKFAKLLLGEDMSGRGKGVSSALALSNAITNLAASAYGEMKKLEPMAPDTKAKWKKEIDWLLSVTDHIVEFVAVKQKNKDGTTFEVMATRQRNDLHMNIPALRKLDMM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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