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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001334`

染色体: Chr07 坐标: 10304188-10307702 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001334`
名称	SmilChr07G001334
描述	gibberellin 3-beta-dioxygenase 4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10304188 - 10307702 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992497`
GeneID	`130992497`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992497`
原始查询	`LOC130992497`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	gibberellin 3-beta-dioxygenase 4
产物	gibberellin 3-beta-dioxygenase 4
Arabidopsis	`AT1G79760` (DTA4) downstream target of AGL15-4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844315] identity=32.4; qcov=0.894; evalue=3.1e-45; confidence=low
Rice	`Os01g0744200` - identity=28.8; qcov=1.04; evalue=2.69e-42; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992497

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057773132.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057773132.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057773132.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773132.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773132.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10304485`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A11,A2,B106,B111,B125,B130,B136,B140,B28,B38,B39,B51,B59,B7,B91,C18,C23,C37,C45,C76,C78,C8,C81,D7
`Chr7:10304487`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	91	A14,A16,A19,A20,A3,A6,A8,B10,B104,B105,B108,B114,B118,B119,B120,B127,B129,B13,B132,B135,B139,B16,B17,B19,B21,B23,B25,B26,B29,B3,B32,B42,B43,B45,B47,B52,B54,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B69,B79,B80,B81,B83,B86,B89,B9,B94,B98,B99,C1,C13,C14,C19,C2,C22,C24,C28,C3,C30,C34,C4,C41,C46,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C7,C71,C73,C74,C80,C82,C84,C86,C9,D2,D5,D6,D8,D9
`Chr7:10304501`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A11,B10,B100,B111
`Chr7:10304501`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A11,B10,B100,B111
`Chr7:10306467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr7:10307114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr7:10307139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,D4
`Chr7:10307221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr7:10307237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773132.1

376 aa

188

376

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 68-158 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 267-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773132.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	68	158	1.5e-07	32.8	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057773132.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	267	329	6.6e-06	27.1	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917149.1
TAAAAAGAAACCATACGAAAGAAAATGAAAGAGAAAAAAGTGAAAATGTAGCTCACAATCCAAACATTTCCATCATTGATGCTTCCTTCTCTTTTACCGTCTTTATTAAACACCAAATCTTTGATACCAACCAAAAATTCACACCAAGAAAAACAATCAAGATCACATTTTTCACACAATGGCCGTGACGCCGGAGCCGTTGCCACGGACCAACGCCGTGGATTTCAGAGCTCCTCCACCGTCTCCGGTGGCGCCGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992497
ATGGCCGTGACGCCGGAGCCGTTGCCACGGACCAACGCCGTGGATTTCAGAGCTCCTCCACCGTCTCCGGTGGCGCCGGGAAGGCAGTCGCCCTTCGCGAACGACGACGTTTTGAGTGAATACCTCCAGCAGTCCCTCAAAGTCCCCGACCTGGTTCTTCCGGACCGGGTTTTTCCCTGCCAGAAATCGGTCCAAAACCCGCCAAGAATCGATTTTGGGAAACTGGGTTCGTTTGAAAGCGAAATGGGTTTCAAAATATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773132.1
MAVTPEPLPRTNAVDFRAPPPSPVAPGRQSPFANDDVLSEYLQQSLKVPDLVLPDRVFPCQKSVQNPPRIDFGKLGSFESEMGFKICDLIAQVGCLELINHGISPDLMGLVLFLAGGIFQIPPEKKKTAARSPERRYGFEEIHGEEEIRDQSEEFLWCDETTMKSEMEGIWPFGFSNFSQEMKKLSRQMEEVGRRIMLFLEQHSLKKFSAENGLPEEQESAGKVWCIEKHGRKMGGDHSLRYDVIRMLIKGSEFSHALSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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