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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000874`

染色体: Chr01 坐标: 18621521-18622292 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000874`
名称	SmilChr01G000874
描述	uncharacterized SmilChr01G000874
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	18621521 - 18622292 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992518`
GeneID	`130992518`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992518`
原始查询	`LOC130992518`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=31.6; qcov=0.773; evalue=3.58e-33; confidence=low
Rice	`Os01g0595300` - identity=30.7; qcov=0.793; evalue=6.56e-29; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992518

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773202.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057773202.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773202.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773202.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773202.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:18621536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr1:18621619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr1:18621676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:18621686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr1:18621702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:18621704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B94,B98,C68
`Chr1:18621707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B124
`Chr1:18621707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr1:18621719`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B128,C80
`Chr1:18621719`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B128,C80
`Chr1:18621731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr1:18621732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773202.1

242 aa

121

242

Transposase_mut

MULE

PF00872 Transposase_mut 128-230 aa PF10551 MULE 129-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773202.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	128	230	2.6e-11	43.7	Transposase, Mutator family
`XP_057773202.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	129	223	1.6e-21	77.2	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917219.1
ATGGATCATACCTGCCACACGGATTTGAATCGCACTGCCCCGAGACAGATTCCGGCGAGGGTTGTTGGAAGATATTTTGCACGGAAATTGGTAGGCGAGGGGGTCGTTTTGAAGCCGAAGGAGATGATGTCAGAGATGCAGCGCTTATTCGGTATTGAGATCAATTACAGCTTCGCTCTCCGTGCAAGAAACATCGCGATTGAGATGACGTATGGTGATTTTGGGAACTCGTATCAGATGCTCCCATCGTATTTGTATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992518
ATGGATCATACCTGCCACACGGATTTGAATCGCACTGCCCCGAGACAGATTCCGGCGAGGGTTGTTGGAAGATATTTTGCACGGAAATTGGTAGGCGAGGGGGTCGTTTTGAAGCCGAAGGAGATGATGTCAGAGATGCAGCGCTTATTCGGTATTGAGATCAATTACAGCTTCGCTCTCCGTGCAAGAAACATCGCGATTGAGATGACGTATGGTGATTTTGGGAACTCGTATCAGATGCTCCCATCGTATTTGTATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773202.1
MDHTCHTDLNRTAPRQIPARVVGRYFARKLVGEGVVLKPKEMMSEMQRLFGIEINYSFALRARNIAIEMTYGDFGNSYQMLPSYLYMLRMSNPGTLYDLEMKDDGKFHHMFVALGQSVAAFEKGYLRPVIVVDGTHLKGRNGGILFVAVTKDGNEAIFPLAVGLGPIENDESWTWFFHRLRTCFGQPDDLLIVSDQHKSIRNAVECVYPNVPHGLCYYHIQKNLAYYGQHTTFKGIFLRFKY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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