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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001440`

染色体: Chr07 坐标: 11158050-11170967 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001440`
名称	SmilChr07G001440
描述	calpain-type cysteine protease DEK1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11158050 - 11170967 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992536`
GeneID	`130992536`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992536`
原始查询	`LOC130992536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calpain-type cysteine protease DEK1
产物	calpain-type cysteine protease DEK1
Arabidopsis	`AT1G55350` (DEK1) calpain-type cysteine protease family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841981] identity=78.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0709400` (ADL1) - identity=72.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004198 (calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00648 (Peptidase_C2); PF01067 (Calpain_III)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992536

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057773184.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057773184.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057773184.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057773184.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773184.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11158678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:11159246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr7:11159311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:11159531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C84,C86
`Chr7:11159657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C32,C60,C68,C8
`Chr7:11160137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,C15,C64,C66
`Chr7:11160575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr7:11161032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B65,B96,C42,D7
`Chr7:11161482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr7:11161683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B51
`Chr7:11162568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr7:11163246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773184.1

2143 aa

1072

2143

Peptidase_C2

Calpain_III

PF00648 Peptidase_C2 1688-1987 aa PF01067 Calpain_III 1998-2133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773184.1`	Pfam	`PF00648`	Peptidase_C2	Family	1688	1987	8.2e-89	298.3	Calpain family cysteine protease
`XP_057773184.1`	Pfam	`PF01067`	Calpain_III	Domain	1998	2133	4.9e-16	59.9	Calpain large subunit, domain III

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917201.1
AAATTATATACTATTTTATTTTAATATCCGAACGCGCACACTTTACTCTTTCTTCTCCACTGCCTGCCTGCCTCTGCTCTCCTCTTTCTCTCTCTCTCTAACGACAACCTAAAGCCCTGCATTCTTTCCACCCCCATATTTCATTTCTTTTTCGTCAAAAAGTGTAGGGTTTTTAAAATTCATCTGCTTTGACCTTAACTCTCACTCTTGTAGAAAAGTTGCTCTTTGCATTTTCAGGTTTCTTGTTTTCTTTTTCTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992536
ATGGAGGAGGAGCATGAGTTGATCCTGGCATGCATAATTTCGGGGTCCCTTTTCTCCGTTCTTGGGGCTGCTTCCTTTTCTATACTCTGGTTGGTCAATTGGCGGCCGTGGCGCATCTACAGTTGGATATTTGCTAGAAAATGGCCGAATTTCCTCCATGGGCCTCAGCTAGGAATATTGTGCAGCCTTCTTTCCCTGGGTTCATGGATAATTGTTATTTCGCCAGTGGTGGTGCTTATTGTTTGGGGATGCTGGTTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773184.1
MEEEHELILACIISGSLFSVLGAASFSILWLVNWRPWRIYSWIFARKWPNFLHGPQLGILCSLLSLGSWIIVISPVVVLIVWGCWLIVILGRDIIGLAVVMAGVALLLAFYSVMLWWRTQWQSSRAVAILLLLAVGLLCAYELCAVYVTAGAKASDRYSPSGFFFGVSAIALAINMLFICRMVFNGNGLDIDEYVRRAYKFAYSDCIEVGPVACLPEPPDPNELYPRQSRRALHLGLLYFGSLVVLLVYSILYGLTAKES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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