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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001400`

染色体: Chr07 坐标: 10873295-10881789 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001400`
名称	SmilChr07G001400
描述	ubinuclein-1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10873295 - 10881789 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992561`
GeneID	`130992561`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992561`
原始查询	`LOC130992561`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubinuclein-1-like
产物	ubinuclein-1-like
Arabidopsis	`AT1G21610` (AT1G21610) wound-responsive family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838762] identity=37.8; qcov=0.852; evalue=2.17e-98; confidence=medium
Rice	`Os01g0883200` - identity=46.9; qcov=0.38; evalue=2.52e-59; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF08729 (HUN); PF14075 (UBN_AB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992561

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773222.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773222.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773222.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773222.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773222.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10873496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr7:10873529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,B82
`Chr7:10873577`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	139	A13,A18,A20,A21,A23,A25,A3,A5,A7,A8,B100,B102,B105,B110,B114,B115,B118,B12,B120,B121,B123,B128,B130,B132,B135,B136,B137,B14,B15,B17,B19,B20,B22,B26,B28,B3,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B44,B46,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B56,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B72,B73,B75,B76,B77,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B96,B97,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C17,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C27,C3,C32,C34,C35,C36,C37,C39,C4,C40,C41,C42,C44,C46,C48,C5,C50,C52,C53,C54,C59,C60,C64,C65,C68,C70,C71,C72,C75,C76,C78,C80,C81,C82,C83,C86,C87,C9,D3,D4
`Chr7:10873604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr7:10873703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B136,B17,B47,C9
`Chr7:10873703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B17,B47,C9
`Chr7:10873704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:10873809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B6,B78,B82,C67
`Chr7:10874860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr7:10879322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:10879778`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B23
`Chr7:10879778`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773222.1

732 aa

366

732

HUN

UBN_AB

PF08729 HUN 129-174 aa PF14075 UBN_AB 411-583 aa

XP_057773223.1

720 aa

360

720

HUN

PF08729 HUN 129-174 aa

XP_057773224.1

686 aa

343

686

HUN

UBN_AB

PF08729 HUN 129-174 aa PF14075 UBN_AB 365-537 aa

XP_057773225.1

674 aa

337

674

HUN

PF08729 HUN 129-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773222.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	129	174	8.7e-14	52.0	HPC2 and ubinuclein domain
`XP_057773222.1`	Pfam	`PF14075`	UBN_AB	Family	411	583	1.9e-06	28.4	Ubinuclein conserved middle domain
`XP_057773223.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	129	174	9e-14	52.0	HPC2 and ubinuclein domain
`XP_057773224.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	129	174	8e-14	52.1	HPC2 and ubinuclein domain
`XP_057773224.1`	Pfam	`PF14075`	UBN_AB	Family	365	537	1.2e-06	29.1	Ubinuclein conserved middle domain
`XP_057773225.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	129	174	8.3e-14	52.1	HPC2 and ubinuclein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917242.1
ACACGTAAGTTCAGTCTTCCATTATTCCTCGTATCAGTCATAGCTGTAACCGTTACAAGTCCAAAATAAATAAATAAAATTAAAACAAAAATAAAACAAAAAAATACTAAGAAAAATGAAAATCTTCTTTCCCTCTCTCTCACTCACTCTCTGATCAGCTCAAATTTAGGGTTTTTTTTTCAAAAATCCCCCCAATTTCGTTACAACCGTAGCCCGAAAGCCTTGTCAATTCATTGATAGAGCATAAAATTGATGGTGGA...

XM_057917241.1
ACACGTAAGTTCAGTCTTCCATTATTCCTCGTATCAGTCATAGCTGTAACCGTTACAAGTCCAAAATAAATAAATAAAATTAAAACAAAAATAAAACAAAAAAATACTAAGAAAAATGAAAATCTTCTTTCCCTCTCTCTCACTCACTCTCTGATCAGCTCAAATTTAGGGTTTTTTTTTCAAAAATCCCCCCAATTTCGTTACAACCGTAGCCCGAAAGCCTTGTCAATTCATTGATAGAGCATAAAATTGATGGTGGA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130992561
ATGGTGGAAGGCGCTGAATCCGGCGGGCCCGAAAATGGGCCCGGTTCGAAACCGGCGCCGTCGGTGGAGGTCGGCGGCGGCCGGGTGAGGTTCAGGGTGGACCTGAAGCCTGGGGAGACCACAATTGTGTCTTGGAAAAAGCTTCTCAAGGAGGCCAATTTGAGTGAGACCGCCCGGCCCGGCCCGTCGGGTTCGGGCCCGTCTCTCGAAGCCCATGGTGGCGTCGTCTCTGAGCCGCTCCCTCCGCCCCCTCCTGCGGC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057773222.1
MVEGAESGGPENGPGSKPAPSVEVGGGRVRFRVDLKPGETTIVSWKKLLKEANLSETARPGPSGSGPSLEAHGGVVSEPLPPPPPAAASHTKETAENEPKESQANRLSNVIERIERMYAGSSDEEDLVLDNMPDDDEYDTDDSFIDDTELDDYFQVDKSAIKHDGFFVNRGKLERIEPSISMDQQPKKRRRKDLAQGGGSGDGHSLHKIMKMENKGKKAASSIPRSSTNQVYKEAISNVQKLGLDSPANPTEVSIKKTAI...

XP_057773223.1
MVEGAESGGPENGPGSKPAPSVEVGGGRVRFRVDLKPGETTIVSWKKLLKEANLSETARPGPSGSGPSLEAHGGVVSEPLPPPPPAAASHTKETAENEPKESQANRLSNVIERIERMYAGSSDEEDLVLDNMPDDDEYDTDDSFIDDTELDDYFQVDKSAIKHDGFFVNRGKLERIEPSISMDQQPKKRRRKDLAQGGGSGDGHSLHKIMKMENKGKKAASSIPRSSTNQVYKEAISNVQKLGLDSPANPTEVSIKKTAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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