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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001447`

染色体: Chr07 坐标: 11251622-11255803 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001447`
名称	SmilChr07G001447
描述	YTH domain-containing protein ECT2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11251622 - 11255803 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992563`
GeneID	`130992563`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992563`
原始查询	`LOC130992563`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	YTH domain-containing protein ECT2-like
产物	YTH domain-containing protein ECT2-like
Arabidopsis	`AT3G13460` (ECT2) evolutionarily conserved C-terminal region 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820548] identity=56.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0158500` - identity=50; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0061157 (mRNA destabilization)
KEGG	-
Pfam	PF04146 (YTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992563

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057773228.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057773228.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057773228.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057773228.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057773228.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11251810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,C41,C74
`Chr7:11252482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D1
`Chr7:11253212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B140,C18
`Chr7:11253270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr7:11253272`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C3,D1
`Chr7:11253272`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C3,D1
`Chr7:11253279`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C3,D1
`Chr7:11253279`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C3,D1
`Chr7:11253302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr7:11253342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C62
`Chr7:11253407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B132,C61
`Chr7:11253515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B86,C10,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773228.1

698 aa

349

698

YTH

PF04146 YTH 443-581 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773228.1`	Pfam	`PF04146`	YTH	Domain	443	581	5.4e-49	166.1	YT521-B-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917245.1
GGTGGTGGTATTTGAGTCACTCATCTCGACTTTCGTTTCTTCTCTCTCTCTCTTCCCAAAACCCAAACCCTTAAAACTTTGGCCTCGCCCGGCTCGCTCGCTCTTTTGTGGCGGCTTTCCCTCCCCATCTCCTCCTAGGGTTCTTTTGTTCTCTCACTCTAAGAAATCTATCCCTCACTCATGGCCGCCGTTGCACCGCCCGCAGATCAGGCTGCAGATTTACTGCAGAAGCTGTCTATGGACTCGCAAGCAAAGACTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992563
ATGGCCGCCGTTGCACCGCCCGCAGATCAGGCTGCAGATTTACTGCAGAAGCTGTCTATGGACTCGCAAGCAAAGACTATTGAAATTCCTGAAGCCACTAAGAAGCCATCAGTTGATTCCGGAAACGTGGCTAATGGAATACAAATGGATCGTTCTGTCACACCTCAAATTCCAGATTTTATGGATCCTACGGTGTGCTACGTTCCAAATTATCCATCTACTGCTTACTACTATGGTGGCTTTGAGGGTAATGAATGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773228.1
MAAVAPPADQAADLLQKLSMDSQAKTIEIPEATKKPSVDSGNVANGIQMDRSVTPQIPDFMDPTVCYVPNYPSTAYYYGGFEGNEWEDYTRYMNPDGVELTPGAYGDNGSLMYHHGYGYSPYGPYSPAASPIPTLGHDGQLYGPQHYQYPTPYFQSLPPTSGPYPSAAAPAKGDVATSVATDQVPLPVDSSNTKSTGIANSGATKGNNGTMVARPTYQNSSFNANGSYGRGALPGGIPASGYQDLRFAFDGLHSPIPWLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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