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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001550`

染色体: Chr07 坐标: 12621092-12623371 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001550`
名称	SmilChr07G001550
描述	uncharacterized SmilChr07G001550
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	12621092 - 12623371 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992569`
GeneID	`130992569`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992569`
原始查询	`LOC130992569`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0490000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os05g0490000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G24080` (AT3G24080) KRR1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821994] identity=45; qcov=1.03; evalue=3.38e-112; confidence=high
Rice	`Os05g0490000` - identity=46; qcov=0.897; evalue=2.92e-122; confidence=high
GO	GO:0000447 (endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0005730 (nucleolus); GO:0030686 (90S preribosome)
KEGG	-
Pfam	PF05178 (Kri1); PF12936 (Kri1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992569

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773236.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057773236.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773236.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773236.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773236.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:12621352`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B72,C9
`Chr7:12621352`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B72,C9
`Chr7:12621498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B122,B34,B76
`Chr7:12621668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr7:12621718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:12622049`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr7:12622049`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B101
`Chr7:12622180`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C51
`Chr7:12622180`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C51
`Chr7:12622226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr7:12622253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr7:12622346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A5,A9,B12,B120

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773236.1

638 aa

319

638

Kri1

Kri1_C

PF05178 Kri1 307-398 aa PF12936 Kri1_C 475-554 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773236.1`	Pfam	`PF05178`	Kri1	Family	307	398	1.4e-22	80.9	KRI1-like family
`XP_057773236.1`	Pfam	`PF12936`	Kri1_C	Family	475	554	1.6e-29	102.6	KRI1-like family C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917253.1
CGCCTCATTGTTAGAAATTACACAGTCCAAGATTTATACACCAAACCCTAGCTTTAGAAAAACCCCAATTTTATTTCAAAAATACTGGTCTTTGCAAATAGTCTCAGTCCTCCGCCGATGGATCGTTTAAAGCTTTTCGACAGCGACGGAGATTCTTCAGACGAAGACCTGTCCAAAATTGAAATCAACCAGGAATTCGCCAAACGCTACGAGCACAACAAGAAGCGAGAGGAACTGCACAGGTACGAAGCTCTCAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992569
ATGGATCGTTTAAAGCTTTTCGACAGCGACGGAGATTCTTCAGACGAAGACCTGTCCAAAATTGAAATCAACCAGGAATTCGCCAAACGCTACGAGCACAACAAGAAGCGAGAGGAACTGCACAGGTACGAAGCTCTCAAGAAGCAGGGTCTAGTCGACTCGTCGGACTCGGATTCCGAGGAATCGTCGTCCGGGGAGGAGGAGTTGATAAAACCGAGCAAGAAGACCGACGCCGCATTTTTCGATGCGTTGATTAAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773236.1
MDRLKLFDSDGDSSDEDLSKIEINQEFAKRYEHNKKREELHRYEALKKQGLVDSSDSDSEESSSGEEELIKPSKKTDAAFFDALIKVKNQDPILKEQDAKLFDSDDEDNTASKKKGKKEKPMYLKDVVSKQLIEAGPEFSDEEEESADDGAKNKLKSYSQEQEELRQQIVKSLEERENDDDDDGDFLRVKSSGNDEEDEEEDGAIGEKLDEYFGEDEKLDNDTIFLKDYFRKRLWLDDEKSKGRGNVEVDVSEDEDELEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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