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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001551`

染色体: Chr07 坐标: 12630863-12637754 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001551`
名称	SmilChr07G001551
描述	uncharacterized SmilChr07G001551
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	12630863 - 12637754 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992592`
GeneID	`130992592`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992592`
原始查询	`LOC130992592`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0165000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0165000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G60580` (AT5G60580) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836179] identity=44.9; qcov=0.961; evalue=1.95e-74; confidence=medium
Rice	`Os02g0165000` - identity=57.7; qcov=0.903; evalue=7.96e-116; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF12906 (RINGv)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992592

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057773269.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057773272.1`
3	Endosome	内体	0.40000	`XP_057773269.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057773269.1`
5	Endosome membrane	内体膜	0.20000	`XP_057773269.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:12632279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B57,B7,B72,C62
`Chr7:12632296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr7:12632615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr7:12635988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C36,C40,C44
`Chr7:12636552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C57,C65,C68
`Chr7:12636576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773269.1

507 aa

254

507

RINGv

PF12906 RINGv 245-292 aa

XP_057773270.1

471 aa

236

471

RINGv

PF12906 RINGv 209-256 aa

XP_057773272.1

359 aa

180

359

RINGv

PF12906 RINGv 245-292 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773269.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	245	292	2e-12	47.7	RING-variant domain
`XP_057773270.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	209	256	1.9e-12	47.9	RING-variant domain
`XP_057773272.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	245	292	1.3e-12	48.4	RING-variant domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917286.1
ACTTAAATCGTCAAATAAAATACTCCATAAATGCTTTGTTTTTATTTGAGAATTTAAAGTTAAAAATTTAAAATTAAAGAAAGAAGCTTTTTCTTGCTTTCCATCATACCTTCCAATGCTAAAAGTCGACACCTTTGTGATTCATTTTTACTCCACAACAGAATTTGGTTGACTCCTTTTCTTTTCTTTTCTGTTCACGGTCCACGACATCTTTCAATGTTCAAACCACACTTATTTATCGAAATTGCTTCCATAGGTTT...

XM_057917289.1
CGTCAAATAAAATACTCCATAAATGCTTTGTTTTTATTTGAGAATTTAAAGTTAAAAATTTAAAATTAAAGAAAGAAGCTTTTTCTTGCTTTCCATCATACCTTCCAATGCTAAAAGTCGACACCTTTGTGATTCATTTTTACTCCACAACAGAATTTGGTTGACTCCTTTTCTTTTCTTTTCTGTTCACGGTCCACGACATCTTTCAATGTTCAAACCACACTTATTTATCGAAATTGCTTCCATAGGTTTTGTTTTGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130992592
ATGGCGGAGAGTAGTGGCGTTGGAACACTGCATCAACCCGCTCAAGAAGATGACCAAAATCTGCACGCCATCTTTGATCAGAGATATGAAAGAGAAGAAGCCACGTTAATGCCACCCAGACGCCCAAATCTCTCATCCTTGGAAATACCTGAAAGATCTTTGGAAGCTGCATTGTCTGATTTCACAAGGATAGACATCCCCAGTCCCAGTTCTACCAGAGCAGGACTGCCTCCGAGACCCAGTTCGGCGAAACTTAAATC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057773269.1
MAESSGVGTLHQPAQEDDQNLHAIFDQRYEREEATLMPPRRPNLSSLEIPERSLEAALSDFTRIDIPSPSSTRAGLPPRPSSAKLKSSVKNMLSQKSFRGKIPSQETEKTVLIIPDVPHSDKPSTSRSFSLNKLLFSPSTKSVHSLPVTPTTVADPKPSLENHADLQSKTLQPEATKFMKRSFSVPVNVKTRSLRRTESSGGLIRVISKHHHPTTVENASPDISPETEDAIEDAGEDIPEEEAVCRICLIELGEGGETLK...

XP_057773270.1
MPPRRPNLSSLEIPERSLEAALSDFTRIDIPSPSSTRAGLPPRPSSAKLKSSVKNMLSQKSFRGKIPSQETEKTVLIIPDVPHSDKPSTSRSFSLNKLLFSPSTKSVHSLPVTPTTVADPKPSLENHADLQSKTLQPEATKFMKRSFSVPVNVKTRSLRRTESSGGLIRVISKHHHPTTVENASPDISPETEDAIEDAGEDIPEEEAVCRICLIELGEGGETLKMECSCKGELALAHQECAVKWFSIKGNKTCDVCKQDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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