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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001388`

染色体: Chr07 坐标: 10770798-10774729 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001388`
名称	SmilChr07G001388
描述	TOM1-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10770798 - 10774729 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992598`
GeneID	`130992598`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992598`
原始查询	`LOC130992598`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TOM1-like protein 4
产物	TOM1-like protein 4
Arabidopsis	`AT1G21380` (AT1G21380) Target of Myb protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838737] identity=49.9; qcov=1.02; evalue=1.1e-145; confidence=high
Rice	`Os11g0199700` - identity=47.9; qcov=1.17; evalue=3.4e-160; confidence=high
GO	GO:0035091 (phosphatidylinositol binding); GO:0043130 (ubiquitin binding); GO:0043328 (protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00790 (VHS); PF03127 (GAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992598

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057773282.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057773282.1`
3	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.40000	`XP_057773282.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057773282.1`
5	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057773282.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10770991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr7:10771027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr7:10771066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B131,B56,B96
`Chr7:10771069`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr7:10771069`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr7:10771072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr7:10771165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B43,B8,C27
`Chr7:10771168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C39
`Chr7:10771215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B62,B73,B84,C17,D5
`Chr7:10771224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr7:10771331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B62,B73,B84,C17,D5
`Chr7:10771341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B5,B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773282.1

499 aa

250

499

VHS

GAT

PF00790 VHS 8-117 aa PF03127 GAT 193-263 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773282.1`	Pfam	`PF00790`	VHS	Repeat	8	117	5.7e-28	98.3	VHS domain
`XP_057773282.1`	Pfam	`PF03127`	GAT	Domain	193	263	9.7e-19	68.1	GAT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917299.1
ATAGTTAAATGAATAACGAAACTTGTTACCAAATCCAAATGGAAGTTGTATTGGATCACCTAATGTACTCAATTTTCTATCGCTTTTTTCTTACCAAACAGGCAAACACGCTCTTAGACCAGTTCTCCCTCCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTTACACTATCGTCGTGGACTAGACAAAGGACCTGAGGAATTCTGACCGGCATTCTTCCGAAGATCCCACCTTTCTTCTTAGAATTCTCTCGCTCCCGATTCCATTCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992598
ATGGCTAATGCGGCAGCTGCTGCGGAGAGGGCTACCAGTGACAAGCTGGCTGGTCCGGATTGGGCAATAAACATCGAGCTTTGTGATATAATAAACATGGATCCTAGGCAGGCGAAAGATGCACTAAAGATAATCAAGAAGAGACTGCGGAGTAAAAGCCCTAAAATTCAGCTCCTTGCACTGTTTGTGCTCGATACTCTGAGCAAAAACTGTGGGGAGCTTATATTTCAGCTGATTGTTGAGCGGGATATTCTGCGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773282.1
MANAAAAAERATSDKLAGPDWAINIELCDIINMDPRQAKDALKIIKKRLRSKSPKIQLLALFVLDTLSKNCGELIFQLIVERDILREMIKIVKKKPDLNVREKILVLVDTWQEALGGTSGRFPQYFAAYNELKTAGVEFPPREETSLTLFTPPQTHTVSEATFPYEDAGIEASLESDASGLSLEEIQTAEGLADVLMEMLTALDPNNSQGVKDEIIVDLVDQCRSYQKRVTLLVNETTDENLLCRGLALNDSLQRVLRRH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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