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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001469`

染色体: Chr07 坐标: 11536459-11539460 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001469`
名称	SmilChr07G001469
描述	putative F-box protein At1g49610
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11536459 - 11539460 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992604`
GeneID	`130992604`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992604`
原始查询	`LOC130992604`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At1g49610
产物	putative F-box protein At1g49610
Arabidopsis	`AT3G03360` (AT3G03360) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821272] identity=25.3; qcov=0.669; evalue=1.79e-09; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992604

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773290.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773290.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773290.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773290.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773290.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11536745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B22,B49,B79,C36
`Chr7:11536751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B140
`Chr7:11536775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:11536948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:11537045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr7:11537856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:11537890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D6
`Chr7:11537890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:11537935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,A5,B111
`Chr7:11537946`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A4,B119,B135,B19,B24,B32,B51,B54,B60,B62,B9,B99,C1,C19,C22,C70,C74,C80,D6
`Chr7:11537976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,A5,B111,C36,C72
`Chr7:11537987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773290.1

482 aa

241

482

F-box

PF00646 F-box 10-49 aa

XP_057773291.1

482 aa

241

482

F-box

PF00646 F-box 10-49 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773290.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	10	49	4.6e-05	23.9	F-box domain
`XP_057773291.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	10	49	4.6e-05	23.9	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917309.1
GACGTTCAGCCTTTAATTTATCACAATTATTTAAAATCTGCCTTCCCGCCGGATTGTCGTCGCCGGGCCATCGCCTCACCGCCGCGCCACCGTCTACGGGCTATAAAAATCTCATATTTTGAAAAAGATGGTTTTATGCAGACCTTTTTTCTACCTTAGATGAATACGAGTCCAACCAAACTCTCTTTTGGACCTTGTGTTACACGCGCTTCAGATGGCCGTTCGATCGTGCTACAAGTTGCCCGCGCGCGTCAGTGTGA...

XM_057917308.1
GACGTTCAGCCTTTAATTTATCACAATTATTTAAAATCTGCCTTCCCGCCGGATTGTCGTCGCCGGGCCATCGCCTCACCGCCGCGCCACCGTCTACGGGCTATAAAAATCTCATATTTTGAAAAAGATGGTTTTATGCAGACCTTTTTTCTACCTTAGATGAATACGAGTCCAACCAAACTCTCTTTTGGACCTTGTGTTACACGCGCTTCAGATGGCCGTTCGATCGTGCTACAAGTTGCCCGCGCGCGTCAGTGTGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130992604
ATGAAACAATCAAAGAGAAGTGACCGACTCAGCGAGTTGCCCGAGTCAGCAATATTTCACATATTGTGGTTTTTGCCGATGACAGATGTGGTTAGGACAATAATTCTATCCAAGCGCTGGAGAAACCTTTGGACCACCACCCCGTTCCTTAATTTCGACACTGAAGCTATGTCGTTTGATGATTATGATAGTGATAATGATGACAGACTTCTCAAGTTCGTTAATCGGGCTTTATTATGCTGGAATGGGAACAGGGTTTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057773290.1
MKQSKRSDRLSELPESAIFHILWFLPMTDVVRTIILSKRWRNLWTTTPFLNFDTEAMSFDDYDSDNDDRLLKFVNRALLCWNGNRVLKFKFVSRQQLIDSTYSDINLWVSFAMRNRVEQLYLNVYCESSSGMDGGKKNVYWVPQFLYSFPSLKELTLIDCNLEIFGDVQWNQLNSLRIEGFKVTARVINQILNGTPRLRVFILRFADAGESLSIQSSSLKELSIDKYFLTHHDLWTFSELRIWTPNLETLEIKGIPYSKC...

XP_057773291.1
MKQSKRSDRLSELPESAIFHILWFLPMTDVVRTIILSKRWRNLWTTTPFLNFDTEAMSFDDYDSDNDDRLLKFVNRALLCWNGNRVLKFKFVSRQQLIDSTYSDINLWVSFAMRNRVEQLYLNVYCESSSGMDGGKKNVYWVPQFLYSFPSLKELTLIDCNLEIFGDVQWNQLNSLRIEGFKVTARVINQILNGTPRLRVFILRFADAGESLSIQSSSLKELSIDKYFLTHHDLWTFSELRIWTPNLETLEIKGIPYSKC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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