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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001444`

染色体: Chr07 坐标: 11226721-11228852 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001444`
名称	SmilChr07G001444
描述	beta-amyrin 28-monooxygenase-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11226721 - 11228852 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992607`
GeneID	`130992607`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992607`
原始查询	`LOC130992607`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-amyrin 28-monooxygenase-like
产物	beta-amyrin 28-monooxygenase-like
Arabidopsis	`AT5G36110` (CYP716A1) cytochrome P450, family 716, subfamily A, polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833607] identity=49.5; qcov=0.945; evalue=1.79e-154; confidence=high
Rice	`Os07g0518500` (OSJNBa0036M16.135-2) - identity=39.9; qcov=0.998; evalue=2.62e-116; confidence=medium
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016125 (sterol metabolic process); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992607

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057773294.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057773294.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773294.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773294.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773294.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11227078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C26
`Chr7:11227117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:11227118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A19,B132,C61
`Chr7:11227203`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B26,B29
`Chr7:11227203`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B26,B29
`Chr7:11227207`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B129,B45
`Chr7:11227207`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B129,B45
`Chr7:11227208`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B45
`Chr7:11227208`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B45
`Chr7:11227282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr7:11227397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B15,C10
`Chr7:11227681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C35,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773294.1

477 aa

238

477

p450

PF00067 p450 33-456 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773294.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	33	456	1e-61	209.9	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917311.1
TTGGCAAGGTCAACATTTCCCACTACGATTGGTAATGCTGTTTATCTTCAACTCCAAATTAATCATGGCAAGGTTCAAAAATCTCTTGATTAAGAGCATCTCACTATATCTTCACAAAACATATCCCCTCCCATTTCTCTGCAATCCAAAATTTCAAATTTAATAAGTGGTGGGGGCTGCCCACTACCGACAGAAACTCGTGGATAAACCTGTTGCACATGAAAATAGATAAGGAAAAGTCAATAAATAAGCATTAGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992607
ATGGCTGCAGTTTTGATTGTTGCAGCTGTTTTGATAATCTTGGTCATAATTTTCGAGCTCTTCACGAGGAGTTCAAGAAACGGGGCCTTGAATTTGCCTCCAGGCAGCTATGGCTGGCCGGTTCTTGGGGAAACGGCGGAGTTCCTCCGTGCTGGACTGGATGGAAAGCCGGAGAAATTTGTTAGAGAGAGAATGGAGAAATACAATTCTCAAGTTTTCAAGACTTGGATCATGGGGGAGCCCATGGCCGTTTTGTGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773294.1
MAAVLIVAAVLIILVIIFELFTRSSRNGALNLPPGSYGWPVLGETAEFLRAGLDGKPEKFVRERMEKYNSQVFKTWIMGEPMAVLCGAAGNKFLFSNENKLVTVWWPSSVRKLLGPCLATSGGEEGRQMRMMVSYFVSPDAFTRLYIKTMDMVSQQHIKTHWQGKEEVKVFPTIKQYTFELACRLFMSLEDGEQIGKLAILFNIFLKGIISIPINLPGARFYRAKKATYAIKNELHKLVRERRGALEQKTALPCQDLLSH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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