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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001399`

染色体: Chr07 坐标: 10869604-10872537 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001399`
名称	SmilChr07G001399
描述	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10869604 - 10872537 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992642`
GeneID	`130992642`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992642`
原始查询	`LOC130992642`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I-like
产物	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I-like
Arabidopsis	`AT2G46290` (AT2G46290) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819237] identity=81.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0308100` (OsWD40-159) - identity=81.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0002183 (cytoplasmic translational initiation); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0071541 (eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF24805 (EIF3I)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992642

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Midbody	Midbody	0.80000	`XP_057773348.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057773348.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.60000	`XP_057773348.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057773348.1`
5	Centrosome	中心体	0.40000	`XP_057773348.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10870782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr7:10871252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr7:10871397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr7:10871913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:10872115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773348.1

326 aa

163

326

EIF3I

WD40

PF24805 EIF3I 1-325 aa PF00400 WD40 42-80 aa PF00400 WD40 136-174 aa PF00400 WD40 188-219 aa PF00400 WD40 284-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773348.1`	Pfam	`PF24805`	EIF3I	Repeat	1	325	2.4e-129	431.8	EIF3I
`XP_057773348.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	42	80	3.8e-43	144.8	WD domain, G-beta repeat
`XP_057773348.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	136	174	3.8e-43	144.8	WD domain, G-beta repeat
`XP_057773348.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	188	219	3.8e-43	144.8	WD domain, G-beta repeat
`XP_057773348.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	284	314	3.8e-43	144.8	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917365.1
ATTTGGTACTATGATCCCTTCTTCTCCCACTATTGTATTGTGACTACTCATTAACAAATCGATCTTAGAGAAAATGAAAAAATGAAAAATATTTAAAGCAAACCGGATCGGGTTAAAGTCCGCCAGCCTTCCAGCTCAAACCAATACTCAAGCAACACAGACACAGTTAGGGTTTTCCGCCGCCGCTGCCGGAAGTTTGACACGATCTGCTCACTGCGAAGCGAAGCAGTTCATTGTTATTCGGTGAGGGAGTGAAAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992642
ATGAGGCCGATTTTGATGAAAGGTCACGAGAGGCCGCTTACGTTTCTCAAGTACAATCGGGAAGGTGATCTTCTCTTCTCCTGCGCCAAGGATCACGACCCCACCGTCTGGTTCGCCGACAACGGCGAGCGCCTCGGCACCTACCGCGGCCACAACGGCGCTGTTTGGACCTGCGATATATCCCGGGATTCCACAAGACTTATAACTGGAAGTGCCGATCAGACTGCAAAGATATGGGATGTCCAAACAGGAACTCCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773348.1
MRPILMKGHERPLTFLKYNREGDLLFSCAKDHDPTVWFADNGERLGTYRGHNGAVWTCDISRDSTRLITGSADQTAKIWDVQTGTPLFTFNFDSPARSVDFAVGDKLAVLTTDPFMGLPSAIHIKRIARDPEDQTGESVLTLKGPQGRINRAVWGPLNRTIISGGEDAVVRIWDAETGKLLKESEKEEGHKKTITSLAKSVDGSHFLTGSLDKSAKLWDARTLKLIKTYVTERPVNAVAMSPLLDHVVLGGGQDASSVTT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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