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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001430`

染色体: Chr07 坐标: 11106567-11110383 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001430`
名称	SmilChr07G001430
描述	peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11106567 - 11110383 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992670`
GeneID	`130992670`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992670`
原始查询	`LOC130992670`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial
产物	peptidyl-tRNA hydrolase%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G19830` (AT5G19830) Peptidyl-tRNA hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832103] identity=71.9; qcov=0.922; evalue=1.13e-89; confidence=high
Rice	`Os01g0693900` - identity=58.5; qcov=0.824; evalue=1.42e-66; confidence=high
GO	GO:0004045 (peptidyl-tRNA hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01195 (Pept_tRNA_hydro)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992670

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057773395.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057773395.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773395.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773395.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773395.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11107084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B84
`Chr7:11107084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:11107567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773395.1

222 aa

111

222

Pept_tRNA_hydro

PF01195 Pept_tRNA_hydro 24-210 aa

XP_057773396.1

222 aa

111

222

Pept_tRNA_hydro

PF01195 Pept_tRNA_hydro 24-210 aa

XP_057773397.1

222 aa

111

222

Pept_tRNA_hydro

PF01195 Pept_tRNA_hydro 24-210 aa

XP_057773398.1

208 aa

104

208

Pept_tRNA_hydro

PF01195 Pept_tRNA_hydro 24-191 aa

XP_057773399.1

208 aa

104

208

Pept_tRNA_hydro

PF01195 Pept_tRNA_hydro 24-191 aa

XP_057773400.1

208 aa

104

208

Pept_tRNA_hydro

PF01195 Pept_tRNA_hydro 24-191 aa

XP_057773401.1

193 aa

193

Pept_tRNA_hydro

PF01195 Pept_tRNA_hydro 24-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773395.1`	Pfam	`PF01195`	Pept_tRNA_hydro	Domain	24	210	8.3e-65	218.8	Peptidyl-tRNA hydrolase
`XP_057773396.1`	Pfam	`PF01195`	Pept_tRNA_hydro	Domain	24	210	8.3e-65	218.8	Peptidyl-tRNA hydrolase
`XP_057773397.1`	Pfam	`PF01195`	Pept_tRNA_hydro	Domain	24	210	8.3e-65	218.8	Peptidyl-tRNA hydrolase
`XP_057773398.1`	Pfam	`PF01195`	Pept_tRNA_hydro	Domain	24	191	2.3e-59	201.1	Peptidyl-tRNA hydrolase
`XP_057773399.1`	Pfam	`PF01195`	Pept_tRNA_hydro	Domain	24	191	2.3e-59	201.1	Peptidyl-tRNA hydrolase
`XP_057773400.1`	Pfam	`PF01195`	Pept_tRNA_hydro	Domain	24	191	2.3e-59	201.1	Peptidyl-tRNA hydrolase
`XP_057773401.1`	Pfam	`PF01195`	Pept_tRNA_hydro	Domain	24	179	1.2e-58	198.8	Peptidyl-tRNA hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

10 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091317.1
CTAAAATACACATAAACTAAAACGTCATAGTTTCATTTTCGTTTTTTCTCTTCATCGTTCTTAAATTCCTCTTCAAGGTTCTTTGGCGAGGCCGACACCTCGTCTGATCGACGCTGCCTCCAACTCTGAACTGCGGCGAGGCCGGCGCCTCGTCGATCCTGCACCACTTTCTCCTGACTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTATCATCGTCCCTTCTCTCAATCTCCATAATTCCAGAACATACTCACAAAAGAATCTACTCCA...

XR_009091316.1
CTAAAATACACATAAACTAAAACGTCATAGTTTCATTTTCGTTTTTTCTCTTCATCGTTCTTAAATTCCTCTTCAAGGTTCTTTGGCGAGGCCGACACCTCGTCTGATCGACGCTGCCTCCAACTCTGAACTGCGGCGAGGCCGGCGCCTCGTCGATCCTGCACCACTTTCTCCTGACTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTATCATCGTCCCTTCTCTCAATCTCCATAATTCCAGAACATACTCACAAAAGAATCTACTCCA...

CDS

7 records

下载 CDS FASTA

LOC130992670
ATGCTTCTAAGGCAGATTCCGAGGCGCTGCATTTACACTGCCGCCGCATCCCCTGAACCGCGGCCTTGGCTTTTTGTGGGTTTGGGCAATCCAGGTGATAAATTTATGGGCACCAGACATAATGTGGGTTTTGAATTCATTGATGCATTTGCGAAATCACATGAGATAGCGATGGACTCTGTCCACTGCAAAGCTATATTTGGAAAAGGTTTCGTAAATGGGGTTCCAGTTTTCTTGGCTAAACCTCAGACTTACATGAA...

Protein

7 records

下载 Protein FASTA

XP_057773395.1
MLLRQIPRRCIYTAAASPEPRPWLFVGLGNPGDKFMGTRHNVGFEFIDAFAKSHEIAMDSVHCKAIFGKGFVNGVPVFLAKPQTYMNLSGESSGPLAAYYKLPLNRVLVLHDDMDLPCGVLRLNPLGNHGRHNGMKSVIYHFRGNREFPRLRIGIGRPAGQMDPKAFLLQKFNARARERIDGALQEGVDALTQVLSKGLTESARCFNKEQKYKHLRLQTMPV

XP_057773396.1
MLLRQIPRRCIYTAAASPEPRPWLFVGLGNPGDKFMGTRHNVGFEFIDAFAKSHEIAMDSVHCKAIFGKGFVNGVPVFLAKPQTYMNLSGESSGPLAAYYKLPLNRVLVLHDDMDLPCGVLRLNPLGNHGRHNGMKSVIYHFRGNREFPRLRIGIGRPAGQMDPKAFLLQKFNARARERIDGALQEGVDALTQVLSKGLTESARCFNKEQKYKHLRLQTMPV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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