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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001428`

染色体: Chr07 坐标: 11099023-11101283 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001428`
名称	SmilChr07G001428
描述	transcription repressor MYB5-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11099023 - 11101283 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992677`
GeneID	`130992677`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992677`
原始查询	`LOC130992677`

查看完整 ID 对照表

已核对的文献基因名映射

这些条目来自人工核对的文献基因名与当前参考基因组的映射。置信度反映映射证据强度，不代表该功能已在本材料中完成实验验证。

文献基因名	映射置信度	映射证据	文献功能摘要
`SmMYB1`	medium-low	BLASTX partial MYB-domain hit; 79.65% identity, 53% query coverage	Promotes phenolic acid biosynthesis, partly through CYP98A14 activation.

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription repressor MYB5-like
产物	transcription repressor MYB5-like
Arabidopsis	`AT3G13540` (MYB5) myb domain protein 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820556] identity=64.8; qcov=1; evalue=6.53e-84; confidence=high
Rice	`Os01g0695900` (OsMyb4) - identity=79; qcov=0.592; evalue=5.29e-67; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992677

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773410.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773410.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773410.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773410.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773410.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11099293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr7:11099297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr7:11099310`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A1,A23,B117,B139,B4,B52,B57,B58,B74,C20,C65
`Chr7:11099383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C31,C61
`Chr7:11100761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,C32,C58,C68,C8
`Chr7:11100782`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B59
`Chr7:11100782`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773410.1

201 aa

100

201

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 29-76 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 32-90 aa PF00249 Myb_DNA-binding 82-127 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 86-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773410.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	29	76	3.5e-34	117.4	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057773410.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	32	90	2.5e-17	63.5	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057773410.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	82	127	3.5e-34	117.4	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057773410.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	86	131	2.5e-17	63.5	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917427.1
ATCGATATCAACTTTTGCTTCTATGGGTAACATTTCGAGAATTGCTAACGATCACCTTTTTACAGTTCACAATAAATAAAAAGAAATGTATTGCTAAATCATTACAAAACTCAAGGAAAATATTGTAGACGCACAAGTAAGAGTAACACGTTGAGAAACGTATGTTTTCTACCATATCAATTAATAAGATAGAGAAAAACAATTAAACCAAACTCAAACGCTATGCTAATAAGAAAGCAGAGCAATAGAGTTTGAGAGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992677
ATGAGAATCCCGTCGACGTCAAGAGCCGGCGGCGAGGGGAAGAAGGCGAAGCCGGCGCCGTGTTGCACGAAAGTGGGGCTGAAGAGGGGGTCGTGGACGGCGGAGGAGGACGAGCTGCTGAGCAACTACATAAAGAGAGAGGGCGAGGGGAGGTGGAGGACTTTGCCGAAGAAGGCGGGGCTCCTCCGTTGCGGGAAGAGCTGCCGTCTCCGTTGGATGAACTACCTCCGTCCTTCCGTCAAGCGCGGCCACATCTCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773410.1
MRIPSTSRAGGEGKKAKPAPCCTKVGLKRGSWTAEEDELLSNYIKREGEGRWRTLPKKAGLLRCGKSCRLRWMNYLRPSVKRGHISADEEDLILRLHRLLGNRWSLIAGRIPGRTDNEIKNYWNTHLSKKLISEGIDPKTHKPFNPNPSIINHSHNRDGDGDGDKGILDCCNDDSLSSFLNSLINDEMFSSQHQDHPAQHY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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