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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003480`

染色体: Chr01 坐标: 53356289-53358515 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003480`
名称	SmilChr01G003480
描述	phospholipase A1-IIgamma-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53356289 - 53358515 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992712`
GeneID	`130992712`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992712`
原始查询	`LOC130992712`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase A1-IIgamma-like
产物	phospholipase A1-IIgamma-like
Arabidopsis	`AT4G18550` (DSEL) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827587] identity=59; qcov=0.959; evalue=7.02e-178; confidence=high
Rice	`Os05g0574000` - identity=55; qcov=0.954; evalue=5.15e-143; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0008970 (glycerophospholipid phospholipase A1 activity)
KEGG	-
Pfam	PF01764 (Lipase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992712

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057773435.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057773435.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773435.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773435.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773435.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53356440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:53356468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,D11
`Chr1:53357854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:53357975`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B83,C59
`Chr1:53357975`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B83,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773435.1

415 aa

208

415

Lipase_3

PF01764 Lipase_3 155-312 aa

XP_057773439.1

415 aa

208

415

Lipase_3

PF01764 Lipase_3 155-312 aa

XP_057773446.1

415 aa

208

415

Lipase_3

PF01764 Lipase_3 155-312 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773435.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	155	312	6.4e-37	127.3	Lipase (class 3)
`XP_057773439.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	155	312	6.4e-37	127.3	Lipase (class 3)
`XP_057773446.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	155	312	6.4e-37	127.3	Lipase (class 3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917463.1
TCCAAGAATCTGAAAACGGAAATCGACACTTCAACCTACTCCACACAACGTTGCCAAAACTGTAAATTGGTAAAAGCAGAATGCTGCATTGCTTCAAGAGAAAGAAAAGAAGGACAGGAAGCACTGAGAAGAAAGCAGCCAGTTCAAGCATTGCCAAGAGATGGAAGATTCTAAGTGGCCTAAACCATTGGGATGGCCTTCTAGACCCTCTAGACCTCGACCTCCGTCGCTACATCATCCACTACGGCCAGATGGCGCAG...

XM_057917452.1
TTAGAAACACATGTCCAGAGCTAGGAAAACAAAAACCTTAAAATGTCAGCATAAATCAAAGTCTAGGTTTTCCTTTTACATCAACATATATACATATACACAACTATTTAAAGCCCCCCCATCTGCAGATAATTTTATGAGAAACTGCAGTTTAATTTTTCGAGGTAAATTGGTAAAAGCAGAATGCTGCATTGCTTCAAGAGAAAGAAAAGAAGGACAGGAAGCACTGAGAAGAAAGCAGCCAGTTCAAGCATTGCCAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130992712
ATGCTGCATTGCTTCAAGAGAAAGAAAAGAAGGACAGGAAGCACTGAGAAGAAAGCAGCCAGTTCAAGCATTGCCAAGAGATGGAAGATTCTAAGTGGCCTAAACCATTGGGATGGCCTTCTAGACCCTCTAGACCTCGACCTCCGTCGCTACATCATCCACTACGGCCAGATGGCGCAGGCAACCTACGACACGTTCAACTCCGAGAGGGCGTCCAAGTATGCCGGGAGCAGCAGATATGCAAAGGGCAACCTCTTCTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057773435.1
MLHCFKRKKRRTGSTEKKAASSSIAKRWKILSGLNHWDGLLDPLDLDLRRYIIHYGQMAQATYDTFNSERASKYAGSSRYAKGNLFSRVGVDKGNPFKYRVTKYFYATSSTQLPDAFIIKSWSREAWSKESNWIGFAAVATDEGKSALGRRDILIAWRGTVMTLEWSNDFEFALVSAPDVFGGDDEVKVHLGWYSIYTSDDPRSPFNKTSARNQVLAEVRRLVEEYKNEEISLTITGHSLGAAVATLNAIDIVTNGYNKP...

XP_057773439.1
MLHCFKRKKRRTGSTEKKAASSSIAKRWKILSGLNHWDGLLDPLDLDLRRYIIHYGQMAQATYDTFNSERASKYAGSSRYAKGNLFSRVGVDKGNPFKYRVTKYFYATSSTQLPDAFIIKSWSREAWSKESNWIGFAAVATDEGKSALGRRDILIAWRGTVMTLEWSNDFEFALVSAPDVFGGDDEVKVHLGWYSIYTSDDPRSPFNKTSARNQVLAEVRRLVEEYKNEEISLTITGHSLGAAVATLNAIDIVTNGYNKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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