当前解析结果
SmilChr07G001577| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001577 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001577 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001577 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 13003750 - 13006074 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992733 |
|---|---|
| GeneID | 130992733 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992733 |
| 原始查询 | LOC130992733 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G27260 (AT5G27260)Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=25.9; qcov=0.421; evalue=2.67e-06; confidence=low |
| Rice | Os02g0328500- identity=33.3; qcov=0.523; evalue=1.51e-22; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF12776 (Myb_DNA-bind_3) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992733 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057773450.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773450.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773450.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057773450.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057773450.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057773450.1PF12776
Myb_DNA-bind_3 26-123 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057773450.1 |
Pfam | PF12776 |
Myb_DNA-bind_3 | Domain | 26 | 123 | 2.1e-08 | 35.7 | Myb/SANT-like DNA-binding domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。