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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003624`

染色体: Chr07 坐标: 42750717-42768508 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003624`
名称	SmilChr07G003624
描述	glycerol-3-phosphate acyltransferase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	42750717 - 42768508 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992741`
GeneID	`130992741`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992741`
原始查询	`LOC130992741`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycerol-3-phosphate acyltransferase, chloroplastic
产物	glycerol-3-phosphate acyltransferase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G32200` (ATS1) phospholipid/glycerol acyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840112] identity=61.5; qcov=0.867; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0577900` (GPAT) - identity=62.2; qcov=0.856; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004366 (glycerol-3-phosphate O-acyltransferase activity); GO:0006650 (glycerophospholipid metabolic process)
KEGG	smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01553 (Acyltransferase); PF14829 (GPAT_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992741

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057773462.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057773462.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773462.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773462.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773462.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:42750878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:42750961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:42754300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C82
`Chr7:42754463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B57,C37
`Chr7:42759548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:42759871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:42763542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773462.1

458 aa

229

458

GPAT_N

Acyltransferase

PF14829 GPAT_N 95-169 aa PF01553 Acyltransferase 212-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773462.1`	Pfam	`PF14829`	GPAT_N	Domain	95	169	9.7e-33	112.7	Glycerol-3-phosphate acyltransferase N-terminal
`XP_057773462.1`	Pfam	`PF01553`	Acyltransferase	Family	212	365	9.4e-16	58.5	Acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091373.1
ACTAAATTCAAAATATAGATTTTCCAAACGAATTATCTTCCGTTCGCACGTTCTCCTTTATCCAGTTCCGATTTCACAAATTTCACACATTTTACACACATTCTCTCACTCTTTCCCACACCCACCAGCGCTTTCAATGATTCTCTCTATTCCTTCCACAGCGAAGCTGTACGCCTGCTCAACTACACCTAGGGTTTCCGCTTCCCATTCCTCTTCCAGGATCTCTTACTTCGTCAAGTCCGTCGGCTGCGGCGGAGCTC...

XR_009091374.1
ACTAAATTCAAAATATAGATTTTCCAAACGAATTATCTTCCGTTCGCACGTTCTCCTTTATCCAGTTCCGATTTCACAAATTTCACACATTTTACACACATTCTCTCACTCTTTCCCACACCCACCAGCGCTTTCAATGATTCTCTCTATTCCTTCCACAGCGAAGCTGTACGCCTGCTCAACTACACCTAGGGTTTCCGCTTCCCATTCCTCTTCCAGGATCTCTTACTTCGTCAAGTCCGTCGGCTGCGGCGGAGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992741
ATGATTCTCTCTATTCCTTCCACAGCGAAGCTGTACGCCTGCTCAACTACACCTAGGGTTTCCGCTTCCCATTCCTCTTCCAGGATCTCTTACTTCGTCAAGTCCGTCGGCTGCGGCGGAGCTCGGAGGCGGACTCGCTCTTCATGTCTTCTCTTCTGTGCGTCGAATCCCTGGGGAACGGCGGAGATGCTCGACGAGAGGAAGAGCTCCTCGAATGCTGCGGCGGCGACGCCGGCGGTCGCCTCCAGCTCCGCCTCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773462.1
MILSIPSTAKLYACSTTPRVSASHSSSRISYFVKSVGCGGARRRTRSSCLLFCASNPWGTAEMLDERKSSSNAAAATPAVASSSASDHHDVSPPRSFLDARSEQDMLLVMQKEAEAGRLPINIAQGMTELYHNYRDAVLRSGHPKADEIVMSNMAIALDRIFSDVQDPFQFSPYHNAIREPFDYYTFGQEYIRPLVEFRNSFLGNISIFNEIEKKLEQGENVILMSNHQTEADPAVIALLLESTNSFIAENLIYVAGDRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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