当前解析结果
SmilChr07G003849| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003849 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003849 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003849 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 47733886 - 47736831 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992747 |
|---|---|
| GeneID | 130992747 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992747 |
| 原始查询 | LOC130992747 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992747 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057773473.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057773473.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773473.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057773473.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057773473.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:47734169 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C20,C24 |
Chr7:47734170 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C24 |
Chr7:47734198 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B19,B34,B88 |
Chr7:47734199 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C32,C48 |
Chr7:47734219 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr7:47734226 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B6 |
Chr7:47734244 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B125,B6,C33 |
Chr7:47734271 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C20 |
Chr7:47734307 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B12,C68 |
Chr7:47734307 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,C68 |
Chr7:47734325 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 23 | A1,A13,A15,A21,A23,A25,B101,B102,B103,B11,B115,B136,B138,B139,B140,B34,B86,C28,C3,C31,C7,C82,C85 |
Chr7:47734349 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 21 | A14,A20,A4,B119,B121,B131,B24,B33,B40,B64,B67,B68,B69,C13,C14,C17,C41,C42,C52,C57,C87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
6 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。