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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003397`

染色体: Chr01 坐标: 52675947-52679104 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003397`
名称	SmilChr01G003397
描述	actin-58-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52675947 - 52679104 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992763`
GeneID	`130992763`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992763`
原始查询	`LOC130992763`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin-58-like
产物	actin-58-like
Arabidopsis	`AT5G09810` (ACT7) actin 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830841] identity=96.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0106600` - identity=96.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04814 (Motor proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00022 (Actin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992763

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057773489.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057773507.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057773489.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057773489.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057773507.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52676384`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D6
`Chr1:52676384`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D6
`Chr1:52676437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:52676545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B132,B15
`Chr1:52676789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,D10
`Chr1:52676794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B62,B74,C45
`Chr1:52676821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B16,B24,C58
`Chr1:52677088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:52677307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B128,B132,B15
`Chr1:52677364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:52677378`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C83
`Chr1:52677378`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773489.1

393 aa

196

393

Actin

PF00022 Actin 5-359 aa

XP_057773497.1

393 aa

196

393

Actin

PF00022 Actin 5-359 aa

XP_057773507.1

377 aa

188

377

Actin

PF00022 Actin 5-377 aa

XP_057773516.1

377 aa

188

377

Actin

PF00022 Actin 5-377 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773489.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	5	359	8.9e-136	453.4	Actin
`XP_057773497.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	5	359	8.9e-136	453.4	Actin
`XP_057773507.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	5	377	5e-148	493.8	Actin
`XP_057773516.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	5	377	5e-148	493.8	Actin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917524.1
TATTTGTTTTGACATATTTTTTTTTTTTTGAATAAATTGTATAAATTTTCGAACACCTTTTTTCTTGAGAAATAGATACTTTTATACCTAATTAAGAAAGGATGATATAATTTTATACCATCTAATGAAGAGTGAATAAATATATTATCATTAAAATTAAATACGATATTGAAAATATGATCCCTATTTTAAATAATAGTAATACCTCATTATACTATCCTTTTATTCATGGGGATAAAAAGCAAACGAAAGTGTATTGG...

XM_057917514.1
TGCATTTCATTTCAACGTCATTTCATTTCATTTTCATACAACACTTTCAAACCCGAATATATAGTTACACTCCCTCACTCTCTCTCTCTGTCTCTCTAAAAATATTCTGCCTGCCATTTTGATTTGCAGTCATTCCCTATATAGCGACTCATCTCGCACACTATTGTTAGCTAGCAGGAGCAGATCGAGAGGTGATTCCAAAACGCTCTTTGTATAAGTTAAGATGGCAGAGGGAGAGGATATTCAACCCCTTGTTGTTG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130992763
ATGGCAGAGGGAGAGGATATTCAACCCCTTGTTGTTGATAATGGTACTGGAATGGTCAAGGCTGGTTTTGCTGGTGATGATGCCCCAAGGGCAGTTTTCCCTAGCATAGTAGGTCGTCCTCGACATACAGGTGTTATGGTTGGGATGGGTCAAAAAGACGCTTATGTAGGGGATGAAGCTCAGTCTAAGAGAGGTATTCTTACGTTGAAGTACCCGATTGAGCATGGTATAGTGAGCAACTGGGACGACATGGAGAAGAT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057773489.1
MAEGEDIQPLVVDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVSNWDDMEKIWHHTFYNELRVGPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYMFTTTAEREIVRDVKEKLAYVALDFEQETETSKNSSSVEKSYELPDGQVITIGAERFRCP...

XP_057773497.1
MAEGEDIQPLVVDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVSNWDDMEKIWHHTFYNELRVGPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYMFTTTAEREIVRDVKEKLAYVALDFEQETETSKNSSSVEKSYELPDGQVITIGAERFRCP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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