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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003762`

染色体: Chr07 坐标: 45953317-45958770 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003762`
名称	SmilChr07G003762
描述	tobamovirus multiplication protein 2A
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	45953317 - 45958770 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992776`
GeneID	`130992776`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992776`
原始查询	`LOC130992776`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tobamovirus multiplication protein 2A
产物	tobamovirus multiplication protein 2A
Arabidopsis	`AT1G32400` (TOM2A) tobamovirus multiplication 2A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840133] identity=66.9; qcov=1; evalue=3.07e-122; confidence=high
Rice	`Os08g0282000` - identity=64.2; qcov=1.01; evalue=1.33e-118; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00335 (Tetraspanin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992776

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057773512.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057773512.1`
3	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.40000	`XP_057773512.1`
4	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057773512.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057773512.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:45953572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:45956810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr7:45957948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B114,B17,B73,C30
`Chr7:45958118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:45958128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773512.1

281 aa

140

281

Tetraspanin

PF00335 Tetraspanin 9-138 aa

XP_057773513.1

281 aa

140

281

Tetraspanin

PF00335 Tetraspanin 9-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773512.1`	Pfam	`PF00335`	Tetraspanin	Family	9	138	3e-15	57.2	Tetraspanin family
`XP_057773513.1`	Pfam	`PF00335`	Tetraspanin	Family	9	138	3e-15	57.2	Tetraspanin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917529.1
AAAATAAAGCAATTTTGGCGCAATGTCGACAGAAGCGAAAGGCCACTTTCACAATTCATTTTTTTTTTAATACAAACAAAATATTAAATCCGCTGATCTCTCCATTTCTCTTCGTCTCTTTCTCGCTGGATGCTTTGATCTGCGATTATTCTCTTGGAGTAAAGGGCTTGAGTTGTTGTATCAGAAGAGAGATTATTCGTTGTACAGAATGGGGTGTAAAGGGTTCTGGGAATGCCTGTTGAAGCTTTTGAACTTCTTAT...

XM_057917530.1
TCTCTCTCGTTTCTTTATCTATTCAATTGAGAAGCTATAAACGAATTTTCTTCTGATCTATTGCCACTATTCTTGTTCCTGAATGTTGTTTTTAGTATTTGTTGATTCCAGCATATCTCACCTTTCTGATGCAGAATTCACATGCATTAATGGTTCTTTATGGGTTAATCTTTCTGTCTCAGCATTTTCTTGAATTATTCTGTGGATAATTTTGGATGCATCTCTGTAATTTTCATATTCATGTATTGGGCTGAATAAGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992776
ATGGGGTGTAAAGGGTTCTGGGAATGCCTGTTGAAGCTTTTGAACTTCTTATTGATGCTTGTGGGTTTGGCTATGGTTGGATATGGCATATACCTCTTCGTGGAGTACAAGAACTCTGCTTCCTCTGGCGGTGATGAGCCCGTTCCCCCGTCAAGTCAGGAGCTTGTACAGCTTGGTCGGCCCATGCTGTTAGCTGTGTCTTTGGCCGATAGCATTTTTGACAAACTCCCAAAGGCATGGTTTATTTATCTCTTTATTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773512.1
MGCKGFWECLLKLLNFLLMLVGLAMVGYGIYLFVEYKNSASSGGDEPVPPSSQELVQLGRPMLLAVSLADSIFDKLPKAWFIYLFIGIGVAVLFVACCGCIGTATRNGCCLTCFSILVILLILVELGLAAFIFFDKSWQEEIPTDKTGNFDEIYKFLKGHWEIVKWVALGAVILEAVIFLLALIVRAANRPADYDSDEEYIGAPRQQIRQPLINRQPVPATGVSAANTLDQRPSRNDAWSTRMREKYGLDTSEFTYNPSE...

XP_057773513.1
MGCKGFWECLLKLLNFLLMLVGLAMVGYGIYLFVEYKNSASSGGDEPVPPSSQELVQLGRPMLLAVSLADSIFDKLPKAWFIYLFIGIGVAVLFVACCGCIGTATRNGCCLTCFSILVILLILVELGLAAFIFFDKSWQEEIPTDKTGNFDEIYKFLKGHWEIVKWVALGAVILEAVIFLLALIVRAANRPADYDSDEEYIGAPRQQIRQPLINRQPVPATGVSAANTLDQRPSRNDAWSTRMREKYGLDTSEFTYNPSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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