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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003795`

染色体: Chr07 坐标: 46734445-46740308 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003795`
名称	SmilChr07G003795
描述	uncharacterized SmilChr07G003795
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	46734445 - 46740308 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992801`
GeneID	`130992801`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992801`
原始查询	`LOC130992801`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	coiled-coil protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834755]; symbol=AT5G47090; hit=AT5G47090; species=arabidopsis; confidence=high
产物	coiled-coil protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834755]; symbol=AT5G47090; hit=AT5G47090; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G47090` (AT5G47090) coiled-coil protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834755] identity=60.2; qcov=0.987; evalue=1.38e-116; confidence=high
Rice	`Os06g0139700` - identity=55.1; qcov=1.03; evalue=2.43e-98; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09747 (CCD97-like_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992801

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773534.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057773534.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773534.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773534.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773534.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:46735086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr7:46735134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B5,B76,C56
`Chr7:46735203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C39
`Chr7:46735242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B13
`Chr7:46735507`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B7
`Chr7:46735507`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B7
`Chr7:46735510`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B65,B83,C23,C59,C87
`Chr7:46735510`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B65,B83,C23,C59,C87
`Chr7:46735546`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	47	A2,A20,A4,A6,B109,B126,B132,B137,B14,B28,B3,B31,B36,B42,B43,B45,B51,B6,B61,B63,B64,B74,B75,B90,B91,B95,B97,C14,C15,C18,C19,C44,C45,C5,C54,C56,C57,C6,C63,C67,C69,C77,C82,D1,D10,D8,D9
`Chr7:46740120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773534.1

303 aa

152

303

CCD97-like_C

PF09747 CCD97-like_C 111-302 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773534.1`	Pfam	`PF09747`	CCD97-like_C	Coiled-coil	111	302	7.8e-53	180.3	Coiled-coil domain containing protein 97-like, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917551.1
CAGCGAGTGAAAAGGAAAAGTTTTATCGTGTTGAAACAAATCCCATTATTTAGGGTTTATTAGTACTACTACTTTTGTAAAATGTGTAATGGCGAAAGAACATAAATACCGAAGCCATTTGAAAGAGAAAAGTTGGAGATGGCGAAATCCGGTAGTGCTGCAATAGGCAGTGAAGCTAAGGAGAGGATAACAGCCAGATTGTCTATCATCGAAGATTTGTACTTTCCCCGCAAGGTACAACCTGCTGATGCAGCTAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992801
ATGGCGAAATCCGGTAGTGCTGCAATAGGCAGTGAAGCTAAGGAGAGGATAACAGCCAGATTGTCTATCATCGAAGATTTGTACTTTCCCCGCAAGGTACAACCTGCTGATGCAGCTAACCCATCACTCCGCAAGTCCCTCCTCCTTGACCTTCTCTCCACCGACGCCCCCGTCTTCCTCGAGCGTTATGGGTCGAAATTATCGCTGGAGGAGCTTAATCACTTTGACGTGTTGAGGGATGATTATGAAATCAATTGGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773534.1
MAKSGSAAIGSEAKERITARLSIIEDLYFPRKVQPADAANPSLRKSLLLDLLSTDAPVFLERYGSKLSLEELNHFDVLRDDYEINWHLNNLRRIMSPTEKDKKSRSAKIKNRRLAYMDKLMVDGHYFSEDAMREREPYLHHEYVGKFQDPSGRNMARPGERWSETLMRRSEEAILVEKIRGEQQRLGVAQSDWVGNEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEKKKKKMEVEQNHNAEMRAANHLVADSSSVEEMQDRMEQFMYVMQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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