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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003398`

染色体: Chr01 坐标: 52693139-52695815 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003398`
名称	SmilChr01G003398
描述	actin-104
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52693139 - 52695815 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992827`
GeneID	`130992827`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992827`
原始查询	`LOC130992827`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin-104
产物	actin-104
Arabidopsis	`AT5G09810` (ACT7) actin 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830841] identity=96.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0106600` - identity=96.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04814 (Motor proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00022 (Actin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992827

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057773563.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057773563.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057773563.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057773563.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057773563.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52694319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B128,B132,B15
`Chr1:52694757`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C35
`Chr1:52694757`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C35
`Chr1:52695239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:52695243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:52695496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773563.1

377 aa

188

377

Actin

PF00022 Actin 5-377 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773563.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	5	377	1e-147	492.8	Actin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917580.1
TACGACTAGGGGTACAAAAAGTTAACTTAACCTAATGCAGGTTGCGACTTGCGAATTACTTTTCACCTCAGGGTTGTGATTTCTCAATTCCAATTTCATTTGCATTTCATTTCAACCTCATTTCCTTTCTTTTTTCCTTTCTTTTTCCAAACGCATTTGAACCCGAATATATAAGAAACATTCTCACTCCCTGGAATTCTCTCTGCCTGTCTCTCTCTTAAAAATTGAGCTCGCTAATTTCTGCTGCTCTCAGTCTCAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992827
ATGGCGGAAGGAGAGGATATTCAACCCCTTGTTGTTGACAATGGTACCGGAATGGTCAAGGCTGGCTTTGCTGGTGATGACGCTCCAAGGGCAGTTTTCCCTAGCATAGTAGGTCGTCCTCGACATACAGGTGTTATGGTTGGGATGGGTCAGAAAGACGCTTATGTAGGGGATGAAGCTCAGTCTAAGAGAGGTATTCTCACGTTGAAGTACCCGATTGAGCATGGTATTGTGAGCAACTGGGATGACATGGAGAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773563.1
MAEGEDIQPLVVDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVSNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYMFTTSAEREIVRDVKEKLAYVALDFEQESETSKNSSSVEKSYELPDGQVITIGAERFRCP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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