Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003833`

染色体: Chr07 坐标: 47442001-47445704 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003833`
名称	SmilChr07G003833
描述	uncharacterized SmilChr07G003833
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	47442001 - 47445704 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992830`
GeneID	`130992830`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992830`
原始查询	`LOC130992830`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0231700; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0231700; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0231700` - identity=22.7; qcov=0.635; evalue=1.67e-16; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992830

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773561.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773561.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773561.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773561.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773561.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

13 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917578.1
TGGTTAATGATCTCGTCATTCTCGCCTTCTCTGTTATGCCCAATTATTTCTGTTAGCTTCGCGCCGTGTTTCTGAAGGGCGCTACGCCGCCAGGAGGTGAGGGACGAAGGCGTGGAAATTGTTGGCGACGTGATTGGCGCTGAGTTCGGCGAAGTCGAGATCAAACTCGGCGATGGTGAAAGAGATCGAGTCGTGCGGGCAACGGGCGAAGTTGAGGGGGCGTACGATTTTTCCGGCAAAGGGGGAGAAATGGAAGTGTT...

XM_057917581.1
TGGTTAATGATCTCGTCATTCTCGCCTTCTCTGTTATGCCCAATTATTTCTGTTAGCTTCGCGCCGTGTTTCTGAAGGGCGCTACGCCGCCAGGAGGTGAGGGACGAAGGCGTGGAAATTGTTGGCGACGTGATTGGCGCTGAGTTCGGCGAAGTCGAGATCAAACTCGGCGATGGTGAAAGAGATCGAGTCGTGCGGGCAACGGGCGAAGTTGAGGGGGCGTACGATTTTTCCGGCAAAGGGGGAGAAATGGAAGTGTT...

CDS

13 records

下载 CDS FASTA

LOC130992830
ATGGAAGTGTTGTGTGTCCTCTGTCTATTATCCGTTGCTCTGCTCGACAATATTGTGAAGAAGCTAAAGAATCCAAATACGCGTGTCACTCGAGATTGTACAGTTAATATGGCTGGCCGAAGAGGTGGACTTCGTGCAACTAGAAGACATGGCAGTGATCCCAATTCTACGTCCTCTGCTTTACGTTCTGACTCGTCTGCGACGGTTGTACCGCACGCTGCTCAAAGTCAAGATAGAACGGAGAACAATATTGGTACTGA...

Protein

13 records

下载 Protein FASTA

XP_057773561.1
MEVLCVLCLLSVALLDNIVKKLKNPNTRVTRDCTVNMAGRRGGLRATRRHGSDPNSTSSALRSDSSATVVPHAAQSQDRTENNIGTETQVHGSPSNRRTRSSRVRGQTSARASRVRGQTSGLGARQALKHAKNRFNVQFRFGARAAVCANTSKFNNEIGKILRTDCSLHYDEWRDVPESVRAPLREKLLTLFDIDVEDQNVIHVINRQMQRSWRSYRYTLHKKFKEIGGDEDPIKAKSIGHKGVKKEDWDYLCDLWASES...

XP_057773562.1
MEVLCVLCLLSVALLDNIVKKLKNPNTRVTRDCTVNMAGRRGGLRATRRHGSDPNSTSSALRSAQSQDRTENNIGTETQVHGSPSNRRTRSSRVRGQTSARASRVRGQTSGLGARQALKHAKNRFNVQFRFGARAAVCANTSKFNNEIGKILRTDCSLHYDEWRDVPESVRAPLREKLLTLFDIDVEDQNVIHVINRQMQRSWRSYRYTLHKKFKEIGGDEDPIKAKSIGHKGVKKEDWDYLCDLWASESYKERAKKNAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器