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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003593`

染色体: Chr07 坐标: 41998202-42003218 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003593`
名称	SmilChr07G003593
描述	protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	41998202 - 42003218 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992843`
GeneID	`130992843`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992843`
原始查询	`LOC130992843`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 1
产物	protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 1
Arabidopsis	`AT4G10840` (KLCR1) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826680] identity=76.1; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0109800` - identity=70.4; qcov=0.909; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13176 (TPR_7); PF13181 (TPR_8); PF13374 (TPR_10); PF13424 (TPR_12); PF14938 (SNAP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992843

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057773585.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057773585.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773585.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773585.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773585.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:41998758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr7:42001538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr7:42001626`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B31
`Chr7:42001626`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B31
`Chr7:42001715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773585.1

603 aa

302

603

TPR_10

TPR_12

TPR_7

TPR_8

TPR_10

TPR_12

SNAP

TPR_12

TPR_8

TPR_12

TPR_10

TPR_8

TPR_12

TPR_10

TPR_8

PF13374 TPR_10 133-172 aa PF13424 TPR_12 133-207 aa PF13176 TPR_7 136-161 aa PF13181 TPR_8 179-206 aa PF13374 TPR_10 180-216 aa PF13424 TPR_12 180-249 aa PF14938 SNAP 256-362 aa PF13424 TPR_12 300-361 aa PF13181 TPR_8 307-329 aa PF13424 TPR_12 342-417 aa PF13374 TPR_10 343-374 aa PF13181 TPR_8 344-374 aa PF13424 TPR_12 471-543 aa PF13374 TPR_10 510-551 aa PF13181 TPR_8 513-542 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF13374`	TPR_10	Repeat	133	172	3.8e-43	145.0	Tetratricopeptide repeat
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF13424`	TPR_12	Repeat	133	207	4.4e-63	210.2	Tetratricopeptide repeat
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF13176`	TPR_7	Repeat	136	161	1e-21	75.8	Tetratricopeptide repeat
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	179	206	5.2e-27	92.4	Tetratricopeptide repeat
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF13374`	TPR_10	Repeat	180	216	3.8e-43	145.0	Tetratricopeptide repeat
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF13424`	TPR_12	Repeat	180	249	4.4e-63	210.2	Tetratricopeptide repeat
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF14938`	SNAP	Repeat	256	362	7.3e-11	42.8	Soluble NSF attachment protein, SNAP
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF13424`	TPR_12	Repeat	300	361	4.4e-63	210.2	Tetratricopeptide repeat
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	307	329	5.2e-27	92.4	Tetratricopeptide repeat
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF13424`	TPR_12	Repeat	342	417	4.4e-63	210.2	Tetratricopeptide repeat
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF13374`	TPR_10	Repeat	343	374	3.8e-43	145.0	Tetratricopeptide repeat
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	344	374	5.2e-27	92.4	Tetratricopeptide repeat
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF13424`	TPR_12	Repeat	471	543	4.4e-63	210.2	Tetratricopeptide repeat
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF13374`	TPR_10	Repeat	510	551	3.8e-43	145.0	Tetratricopeptide repeat
`XP_057773585.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	513	542	5.2e-27	92.4	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917602.1
AGGACCTGATATACGATGGCACTTGATAATTACAGTTGTATTCAATCCTTTCTCAACCTCACTATATTCACCCCAACGGCCATCTCTCTCTCTCATCTTCCACAGTCTTTCTCACCAGCAAGCAACACTTGAAAAATGGTGGCCTGTATTAATCCCCACCCCATAATTATTAATTAACTCTCTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGGGAATTAACTCTCTTAATTAATCCTCCCTATTTAATTAGTTCCCCTCCATTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992843
ATGCCGGGCTTAGTCTCCGTCAAGACGCCGCCGGACGCGCCGCCGCTGAGAATCACCGTCCCCGACGAGCAGCCCCACACTCCGATCCGAGCTCAAACGGTCAGATCCGAGCCCAAATCTAACTCCCCCGCCACGCGCCGCCCGCCCTCCCCTTCTCCCTCCACCTCACGCGCCAAACCATCGCCGGATCGGGGCTCCGCCAAGAAGAAATCCCCACCCGAGAAGAACCTCCTCAACGAAGCCTCTCTCGACAACCCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773585.1
MPGLVSVKTPPDAPPLRITVPDEQPHTPIRAQTVRSEPKSNSPATRRPPSPSPSTSRAKPSPDRGSAKKKSPPEKNLLNEASLDNPDLGPFLLKLARDTIASGEGPSKALDYALRASKSFEKCAVDGEPSLDLAMSLHVVAAIYCSLGKFEEAVPVLERAIKVPEVARGADHALAAFSGYMQLGDTHSMLGQLDRSIECYKEGLKIQMEALGDNDPRVAETCRYLAEAHVQAMQFDEADNLCKKTLEIHRVHSPPASLEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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