当前解析结果
SmilChr07G003432| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003432 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003432 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003432 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 37730784 - 37732882 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992869 |
|---|---|
| GeneID | 130992869 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992869 |
| 原始查询 | LOC130992869 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992869 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057773607.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057773607.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773607.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773607.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057773607.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:37732077 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 42 | A16,A18,A20,B104,B112,B114,B117,B132,B138,B2,B22,B32,B41,B46,B53,B6,B61,B69,B70,B73,B88,B91,C1,C15,C24,C27,C29,C30,C38,C45,C48,C49,C5,C53,C54,C64,C66,C68,C74,C78,C85,D11 |
Chr7:37732085 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,A21,B101,B128 |
Chr7:37732099 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 14 | B102,B103,B22,B33,B41,B48,B50,B57,B59,B78,C16,C25,C58,C83 |
Chr7:37732100 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 140 | A1,A10,A11,A14,A19,A21,A23,A24,A4,A5,A6,A7,A9,B100,B102,B105,B107,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B115,B118,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B131,B134,B137,B138,B140,B15,B16,B19,B20,B24,B26,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B40,B41,B44,B46,B5,B50,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B61,B64,B66,B67,B68,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B82,B84,B86,B87,B88,B92,B93,B96,B97,C1,C10,C11,C15,C20,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C42,C43,C45,C46,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C54,C57,C58,C6,C61,C63,C64,C65,C68,C69,C70,C72,C76,C77,C79,C8,C85,C86,C87,C9,D11,D3,D6 |
Chr7:37732134 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D2 |
Chr7:37732137 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B52,C55 |
Chr7:37732142 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B135,B26 |
Chr7:37732143 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B135,B26 |
Chr7:37732156 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B108,B99 |
Chr7:37732193 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B130,C71 |
Chr7:37732193 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B130,C71 |
Chr7:37732713 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A2,C41 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。