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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003433`

染色体: Chr07 坐标: 37735892-37738915 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003433`
名称	SmilChr07G003433
描述	uncharacterized SmilChr07G003433
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	37735892 - 37738915 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992870`
GeneID	`130992870`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992870`
原始查询	`LOC130992870`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819066]; symbol=AT2G44580; hit=AT2G44580; species=arabidopsis; confidence=high
产物	zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819066]; symbol=AT2G44580; hit=AT2G44580; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G44580` (AT2G44580) zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819066] identity=57.7; qcov=0.985; evalue=6.19e-159; confidence=high
Rice	`Os05g0119600` - identity=55.4; qcov=0.99; evalue=3.79e-152; confidence=high
GO	GO:0000775 (chromosome, centromeric region); GO:0000785 (chromatin); GO:0005634 (nucleus); GO:0007064 (mitotic sister chromatid cohesion); GO:0031390 (Ctf18 RFC-like complex); GO:0034088 (maintenance of mitotic sister chromatid cohesion)
KEGG	-
Pfam	PF09724 (Dcc1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992870

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773609.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057773609.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773609.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773609.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773609.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:37737716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,D9
`Chr7:37737769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:37737802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B119,B126,B72,C31
`Chr7:37737829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:37737950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:37738268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B12,B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773609.1

396 aa

198

396

Dcc1

PF09724 Dcc1 41-362 aa

XP_057773610.1

396 aa

198

396

Dcc1

PF09724 Dcc1 41-362 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773609.1`	Pfam	`PF09724`	Dcc1	Family	41	362	1e-91	308.5	Sister chromatid cohesion protein Dcc1
`XP_057773610.1`	Pfam	`PF09724`	Dcc1	Family	41	362	1e-91	308.5	Sister chromatid cohesion protein Dcc1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091454.1
TTGAAAAAAACTCAAAACCTTACGGAAGTAAACGAGTTCTCGCGCTCTCGCACTCTTACCGCTGACACCATCATTCTTTTATCCTTCTTGAACCCTAATTTCCCTTCTCCCTCGTCTGCGTCTTCAAATCCAGAGTTTGGGGACACAGCAGCAGATTCAAGAAAAGCTCTAGATCAGTTATCATTTCTTGATCTATTCCTTCCTGGTAGCTGTTGTGACTGGGAACGGACATAATGAAAGGGTGAAATCTTGTCCACAAT...

XR_009091455.1
AAAACTCAAAACCTTACGGAAGTAAACGAGTTCTCGCGCTCTCGCACTCTTACCGCTGACACCATCATTCTTTTATCCTTCTTGAACCCTAATTTCCCTTCTCCCTCGTCTGCGTCTTCAAATCCAGAGTTTGGGGACACAGCAGCAGATTCAAGAAAAGCTCTAGATCAGTTATCATTTCTTGATCTATTCCTTCCTGGTAGCTGTTGTGACTGGGAACGGACATAATGAAAGGGTGAAATCTTGTCCACAATTGTTAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992870
ATGGATAATTTACACCAGCAAACTGCATGCACTGCTGGTGCAGAAGCAGTTCTAAGCCTTCAACCCAGCTCTTCAATATCTCTCACTTATCATTCTCTGTTTGGCCCCCACAATGACCTTATGCTTCTTGAACTCGACAACAGGCTCCTCCCTGAAATCATGAATCAAAGAGTAACATTAAGAGGACAGCCTGATGAAGATGCAGTTTTGTGTACTTCATCAAAGACCTATGCTGTTAAATTTGTGGGTACATCCAACTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773609.1
MDNLHQQTACTAGAEAVLSLQPSSSISLTYHSLFGPHNDLMLLELDNRLLPEIMNQRVTLRGQPDEDAVLCTSSKTYAVKFVGTSNSVLLIPPSDDVSGSCNNKDGDSMVVASVLKVAPGCMELVEVAPKLDELKVLLSQNPYSFSEDSEMDTSEGREKTGLGLYRWEDLVERIQASDEELKMGLQSLSAVEIDGYWRILDDSYTHTILSMLLHNVILNDWSVNALNEDEVLGVLESDGFPRNIAEHCMQAYCSKVDDGD...

XP_057773610.1
MDNLHQQTACTAGAEAVLSLQPSSSISLTYHSLFGPHNDLMLLELDNRLLPEIMNQRVTLRGQPDEDAVLCTSSKTYAVKFVGTSNSVLLIPPSDDVSGSCNNKDGDSMVVASVLKVAPGCMELVEVAPKLDELKVLLSQNPYSFSEDSEMDTSEGREKTGLGLYRWEDLVERIQASDEELKMGLQSLSAVEIDGYWRILDDSYTHTILSMLLHNVILNDWSVNALNEDEVLGVLESDGFPRNIAEHCMQAYCSKVDDGD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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