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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003451`

染色体: Chr07 坐标: 38539351-38548484 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003451`
名称	SmilChr07G003451
描述	nuclear pore complex protein NUP98A
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	38539351 - 38548484 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992874`
GeneID	`130992874`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992874`
原始查询	`LOC130992874`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear pore complex protein NUP98A
产物	nuclear pore complex protein NUP98A
Arabidopsis	`AT1G10390` (AT1G10390) Nucleoporin autopeptidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837579] identity=61.6; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0165900` (OsNucAP2) - identity=44.7; qcov=1.09; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0000973 (post-transcriptional tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery); GO:0005643 (nuclear pore); GO:0006405 (RNA export from nucleus); GO:0006606 (protein import into nucleus); GO:0017056 (structural constituent of nuclear pore); GO:0044614 (nuclear pore cytoplasmic filaments)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04096 (Nucleoporin2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992874

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773616.1`
2	Nuclear pore complex	核孔复合体	1.00000	`XP_057773616.1`
3	Nucleus membrane	核膜	1.00000	`XP_057773616.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057773616.1`
5	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057773616.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:38540362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:38540465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,D5,D6
`Chr7:38541293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:38541399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:38541582`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D1
`Chr7:38541582`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D1
`Chr7:38541584`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D1
`Chr7:38541584`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D1
`Chr7:38541843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr7:38542826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr7:38542910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C25
`Chr7:38543103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B112,D1,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773616.1

1019 aa

510

1019

Nucleoporin2

PF04096 Nucleoporin2 857-1003 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773616.1`	Pfam	`PF04096`	Nucleoporin2	Domain	857	1003	2.4e-45	155.0	Nup98-96 autopeptidase S59

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917633.1
AAAAGCCCACTATAGCTAGTTTTATAGTTTTATACACTATCTAATAAGTTGATCGATCCCCAATTAGTCGGTTTCTCTTAAAATAATTGATTTTCGTCTGCTCCTCCCGATTTCCTCCGACTTTCTGCTTCTTCTCTACGCGACCCTACTCGTCGATTGCCGCCGTCTCGCTGCCGGTGGATCCCTCGCTCTTTCCGGATTCTCGTCGAAGGTTAACGAATACGCACTACTGGCCTTATTTGCTGAAGAAAAATGTTCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992874
ATGTTCGGAAGCAACCCTTTTGGGCAGTCATCTAGTAGCCCATTTGGGTCTCAACCTGTTTTTGGGCAGACTAGTAGCACTACTAGCAATCCTTTTGCCCCTAAACCTTTTGGTAGTAGTACCAGCCCTTTTGGCTCGCAGACAGGGGGTTCCATTTTTGGCGGCATGTCTACTGGTGTTTTTGGTGCCCAATCTTCTTCTCCTCTAGGATCCACTTCTGTTTTTGGTGCATCGTCATCACCTGCTTTTGGAAGCTCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773616.1
MFGSNPFGQSSSSPFGSQPVFGQTSSTTSNPFAPKPFGSSTSPFGSQTGGSIFGGMSTGVFGAQSSSPLGSTSVFGASSSPAFGSSTPTFGASTGSAFGNSSSAFGGTSVFGQKPTFGGFGSNTTPSSPFGGSFQQSQPAFGSNLFGSSTPFGAPSQPAFGASSSPAFGAPSTPAFGATSTPAFGSTASPTFGSTSGGFGVSSSPFGSSTPAFGASSTPAFGASSTPAFGATAAPAFGATSSPAFGATTSSAFGASSAPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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