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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003511`

染色体: Chr07 坐标: 40021803-40024602 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003511`
名称	SmilChr07G003511
描述	methionine gamma-lyase
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	40021803 - 40024602 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992880`
GeneID	`130992880`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992880`
原始查询	`LOC130992880`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methionine gamma-lyase
产物	methionine gamma-lyase
Arabidopsis	`AT1G64660` (MGL) methionine gamma-lyase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842774] identity=73.9; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0517500` (RRJ1) - identity=74.2; qcov=0.889; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016846 (carbon-sulfur lyase activity); GO:0019346 (transsulfuration); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00450 (Selenocompound metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2); PF00266 (Aminotran_5); PF01053 (Cys_Met_Meta_PP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992880

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057773622.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057773622.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057773622.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057773622.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773622.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:40021962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:40022297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:40022400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:40023606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr7:40023654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:40023768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C13,C37,C67,C74,D6
`Chr7:40023945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:40024108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr7:40024128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:40024148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C83
`Chr7:40024158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773622.1

441 aa

220

441

Cys_Met_Meta_PP

Aminotran_1_2

Aminotran_5

PF01053 Cys_Met_Meta_PP 46-415 aa PF00155 Aminotran_1_2 107-271 aa PF00266 Aminotran_5 113-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773622.1`	Pfam	`PF01053`	Cys_Met_Meta_PP	Domain	46	415	8.3e-79	265.6	Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme
`XP_057773622.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	107	271	2.1e-07	31.2	Aminotransferase class I and II
`XP_057773622.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	113	277	3.3e-07	30.3	Aminotransferase class-V

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917639.1
TGAACTTCATGTTTCATACATTCTGACGTCATATTACATTTGGCAAAGAAAATTAATGAGCAGAGTACAGTGTGGGCACCTTTCCAAGTAAGCATTAAGCTTGGATAATGATAATCTTGAAGCTGTTTATACTAAATAATATTGGCTATAATCCTACTAAGTAAATAAATACATTAATGAATAAAATAGGAATGAATCTGGACGCTCCTTGCACTCTATAAATAGAGACACCATTCCACAAGCCTCTCACAAAACCCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992880
ATGGCAACCATGGTTAGCAAGAAAAGGTCGGGCTCATCCGACGACCATTGGGAGCCCTTCTCAGCCGCCAAGAAGCACCAGTCGGCGCACGCGGAGGACCCCGCGGCGGCGCTGGCGACCGCCCGGCACGAGTTCGGCGAGCACGGCGGCGTGAACATGTCAATCGAGGCGTCGGCCACGTTCACGGTGATGGAGCCGGAGACGATGCGGCGGATGTTCAGCGGCGAGCTGGGCCCCGAGCGCGACTTCTTCATCTACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773622.1
MATMVSKKRSGSSDDHWEPFSAAKKHQSAHAEDPAAALATARHEFGEHGGVNMSIEASATFTVMEPETMRRMFSGELGPERDFFIYSRHFNPTVLNLGRLMAALEGTEAAYCTASGMSAVSSVLLQLCSAGGHVVASQTLYGGTHTLLAHFLPRTCNITTTFVDIRDHGAVRQAMLQGRTNVLYFETMSNPTLTVANVPDLCRMAHDKGVTVVVDNTFSPMVVSPARLGADVVLHSMSKFISGGADLIAGAVCGPASLVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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