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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003578`

染色体: Chr07 坐标: 41838616-41841085 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003578`
名称	SmilChr07G003578
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	41838616 - 41841085 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992982`
GeneID	`130992982`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992982`
原始查询	`LOC130992982`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=32.9; qcov=1.02; evalue=3.32e-63; confidence=low
Rice	`Os08g0106900` - identity=41.6; qcov=0.966; evalue=1.62e-81; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992982

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773675.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057773675.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057773675.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773675.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773675.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:41838677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C28,C5
`Chr7:41838680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B101,B24,B53,C39,D5
`Chr7:41838680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B24,B53,C39,D5
`Chr7:41838740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B57,B90,B92,C61
`Chr7:41838748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C19
`Chr7:41838750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:41838756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C39
`Chr7:41838815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:41838837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B86
`Chr7:41838841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B120,B18,C24,C27
`Chr7:41838858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C82
`Chr7:41838875`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B65,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773675.1

353 aa

176

353

DUF8040

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 9-98 aa PF01609 DDE_Tnp_1 123-290 aa PF13359 DDE_Tnp_4 130-288 aa

XP_057773676.1

353 aa

176

353

DUF8040

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 9-98 aa PF01609 DDE_Tnp_1 123-290 aa PF13359 DDE_Tnp_4 130-288 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773675.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	9	98	5e-23	81.5	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057773675.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	123	290	1.5e-08	35.3	Transposase DDE domain
`XP_057773675.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	130	288	1.1e-23	84.3	DDE superfamily endonuclease
`XP_057773676.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	9	98	5e-23	81.5	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057773676.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	123	290	1.5e-08	35.3	Transposase DDE domain
`XP_057773676.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	130	288	1.1e-23	84.3	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917692.1
ATAAAAAAAAAGGAAACGTGGGAATGGTGGTAAAGCATATGAGATGCTTAGCAGAATGCCTGACCAAAATAAGCACTTACACCGCCTGATAGGAACCAACGATGTTGATTGCATTGCCAATTTGCGTATGGACCGTAACACGTTTGGGCGGTTGTGTCACATATTACGAGAAGTAGGAGGTCTAGTGCCAGGTAATTACGTCACCGTTGAAGAACAAGTAGCTATGTTCTTGTCTGTCCTAGCACATCATAAAAAGAATA...

XM_057917693.1
ATAAAAAAAAAGGAAACGTGGGAATGGTGGTAAAGCATATGAGATGCTTAGCAGAATGCCTGACCAAAATAAGCACTTACACCGCCTGATAGGAACCAACGATGTTGATTGCATTGCCAATTTGCGTATGGACCGTAACACGTTTGGGCGGTTGTGTCACATATTACGAGAAGTAGGAGGTCTAGTGCCAGGTAATTACGTCACCGTTGAAGAACAAGTAGCTATGTTCTTGTCTGTCCTAGCACATCATAAAAAGAATA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992982
ATGCTTAGCAGAATGCCTGACCAAAATAAGCACTTACACCGCCTGATAGGAACCAACGATGTTGATTGCATTGCCAATTTGCGTATGGACCGTAACACGTTTGGGCGGTTGTGTCACATATTACGAGAAGTAGGAGGTCTAGTGCCAGGTAATTACGTCACCGTTGAAGAACAAGTAGCTATGTTCTTGTCTGTCCTAGCACATCATAAAAAGAATAGGGTCGTAAGATTTGATTTTTGGAGGAGTGGTCAGACCATTTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773675.1
MLSRMPDQNKHLHRLIGTNDVDCIANLRMDRNTFGRLCHILREVGGLVPGNYVTVEEQVAMFLSVLAHHKKNRVVRFDFWRSGQTISHYVHAVLGAILNLHQIFLSKPTPVPYDCTEPRWQWFKGCLGALDGTYINVTVSNNDKPRYRTWKGQISTNVLGVCDRDMKFVYILSGWEGSAADSRILRDALNRPHGLKVPKGSYYLCDNGYANSDGFLTPYKGVRYHLKEWGSNAGRPQNKEELFNLRHSKARNVIERAFGI...

XP_057773676.1
MLSRMPDQNKHLHRLIGTNDVDCIANLRMDRNTFGRLCHILREVGGLVPGNYVTVEEQVAMFLSVLAHHKKNRVVRFDFWRSGQTISHYVHAVLGAILNLHQIFLSKPTPVPYDCTEPRWQWFKGCLGALDGTYINVTVSNNDKPRYRTWKGQISTNVLGVCDRDMKFVYILSGWEGSAADSRILRDALNRPHGLKVPKGSYYLCDNGYANSDGFLTPYKGVRYHLKEWGSNAGRPQNKEELFNLRHSKARNVIERAFGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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