当前解析结果
SmilChr07G003583| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003583 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003583 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003583 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 41866980 - 41869047 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992987 |
|---|---|
| GeneID | 130992987 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992987 |
| 原始查询 | LOC130992987 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992987 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057773681.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057773683.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057773682.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773682.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057773682.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:41867134 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B44,B65,D6 |
Chr7:41867134 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B44,B65,D6 |
Chr7:41867285 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | A8 |
Chr7:41867285 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A8 |
Chr7:41867290 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B128,C74 |
Chr7:41867295 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr7:41867349 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B71,D8 |
Chr7:41867357 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C65 |
Chr7:41867406 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 29 | A2,A5,B104,B106,B11,B114,B13,B17,B2,B20,B25,B29,B37,B52,B60,B71,B77,B8,B86,C17,C2,C21,C30,C39,C58,C6,C62,C7,C78 |
Chr7:41867592 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | C19,C26,C82,C83 |
Chr7:41867592 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | C19,C26,C82,C83 |
Chr7:41867595 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C72 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。