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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000067`

染色体: Chr07 坐标: 309740-311182 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000067`
名称	SmilChr07G000067
描述	deacetoxyvindoline 4-hydroxylase-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	309740 - 311182 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993000`
GeneID	`130993000`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993000`
原始查询	`LOC130993000`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	deacetoxyvindoline 4-hydroxylase-like
产物	deacetoxyvindoline 4-hydroxylase-like
Arabidopsis	`AT1G06620` (AT1G06620) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837171] identity=35.6; qcov=1.04; evalue=2.26e-58; confidence=medium
Rice	`Os03g0690500` - identity=34.2; qcov=1.05; evalue=8.33e-48; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993000

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057773704.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057773704.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773704.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773704.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773704.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:310216`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B108,B8,C36,C48,D11
`Chr7:310216`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B108,B8,C36,C48,D11
`Chr7:310221`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	113	A10,A13,A15,A18,A22,A23,A24,A25,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B103,B106,B108,B11,B111,B113,B114,B117,B12,B123,B124,B129,B130,B137,B138,B14,B16,B21,B25,B27,B30,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B45,B47,B48,B49,B50,B51,B53,B54,B55,B56,B60,B65,B70,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B83,B86,B87,B89,B91,B94,B95,B96,B97,C11,C12,C19,C21,C23,C24,C25,C28,C29,C3,C31,C34,C35,C36,C4,C40,C43,C45,C46,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C59,C60,C63,C69,C70,C73,C75,C77,C8,C80,C81,C9,D11,D2,D6,D8
`Chr7:310279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr7:310280`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A10,A18,B108,B117,B8,C36,C48,D11
`Chr7:310285`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A10,A18,B108,B117,B8,C36,C48,D11
`Chr7:310293`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	B129,B14,B42,B43,B84,C38,C42,C6,C65,C76,C77
`Chr7:310302`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	158	A1,A10,A11,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A24,A3,A5,A7,B10,B102,B104,B105,B107,B108,B109,B110,B112,B114,B115,B117,B12,B120,B121,B122,B126,B127,B128,B13,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B139,B140,B17,B18,B2,B20,B21,B22,B24,B26,B28,B32,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B44,B46,B48,B5,B50,B53,B56,B58,B59,B61,B62,B63,B64,B66,B67,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B79,B80,B81,B82,B85,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C2,C20,C22,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C37,C38,C39,C40,C44,C47,C48,C5,C50,C51,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C63,C67,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C78,C79,C8,C80,C83,C84,C86,C87,D1,D2,D3,D4,D5,D7,D9
`Chr7:310306`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A11,B11,B110,B111,B112,B136,B3,B33,B6,B65,B70,B73,B8,B86,C22,C57,C67,C7,C72,C82,D1
`Chr7:310323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B117
`Chr7:310345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr7:310387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B114,B95,C38,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773704.1

345 aa

172

345

DIOX_N

PF14226 DIOX_N 67-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773704.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	67	164	3.3e-17	63.9	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917721.1
CCTACGAATATTTTCAACAACGTAGAACAAGAACTTAATTCCTCCACACAATTTTCATATTCTGCAGCATTATCCTTTCCCACAGACTGAGAAATGGACTCATCCAGCTTGAAAAATTGCTCGCAAGAAAACGAGGCCGATCGCGTGCACGAGCTGAACGCTTTCGAGGCCACAAAAGCCGGCGTGAAGGGGCTCACCGACTCCGGCGTCCAGAAGGTTCCGAGAATGTTCATCAGGCCAGCCGACGAGCTCGTCGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993000
ATGGACTCATCCAGCTTGAAAAATTGCTCGCAAGAAAACGAGGCCGATCGCGTGCACGAGCTGAACGCTTTCGAGGCCACAAAAGCCGGCGTGAAGGGGCTCACCGACTCCGGCGTCCAGAAGGTTCCGAGAATGTTCATCAGGCCAGCCGACGAGCTCGTCGAGGAGCGCAACCGGAGCCGCTCCCCGCTGCAAGCTCCGGTGATAGACCTCGGCCGGATCGGGGAGGGCGAGGGGCGGGAGAAGGTCGTGAGCGAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773704.1
MDSSSLKNCSQENEADRVHELNAFEATKAGVKGLTDSGVQKVPRMFIRPADELVEERNRSRSPLQAPVIDLGRIGEGEGREKVVSEVRWASKELGIFQIVNHGVAVEVMDAMIDGVRKFHEQDAEAKKQFHTRDAMRKVMYASNVDLYKSRAANWRDTFSVALMGSDSVEPEELPEICRLVYRFLIIHAYSIYSNNSLTKHHNQCETISPLTLHFTGFLKSRVVSYYACFYGTEGDNLFNFMFFVRILTPMNVMNDLQIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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