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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003651`

染色体: Chr07 坐标: 43371532-43379990 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003651`
名称	SmilChr07G003651
描述	syntaxin-22-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	43371532 - 43379990 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993001`
GeneID	`130993001`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993001`
原始查询	`LOC130993001`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	syntaxin-22-like
产物	syntaxin-22-like
Arabidopsis	`AT5G46860` (VAM3) Syntaxin/t-SNARE family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834730] identity=77.8; qcov=0.956; evalue=3.72e-146; confidence=high
Rice	`Os01g0254900` - identity=74.6; qcov=0.982; evalue=7.63e-134; confidence=high
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005484 (SNAP receptor activity); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006906 (vesicle fusion); GO:0012505 (endomembrane system); GO:0016020 (membrane); GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0031201 (SNARE complex); GO:0048278 (GO:0048278)
KEGG	-
Pfam	PF05739 (SNARE); PF14523 (Syntaxin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993001

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057773705.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057773705.1`
3	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057773706.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057773705.1`
5	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057773706.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:43375546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:43377632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B19,B67,C39,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773705.1

274 aa

137

274

Syntaxin_2

SNARE

PF14523 Syntaxin_2 26-163 aa PF05739 SNARE 183-260 aa

XP_057773706.1

273 aa

136

273

Syntaxin_2

SNARE

PF14523 Syntaxin_2 26-162 aa PF05739 SNARE 182-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773705.1`	Pfam	`PF14523`	Syntaxin_2	Domain	26	163	3.5e-36	124.9	Syntaxin-like protein
`XP_057773705.1`	Pfam	`PF05739`	SNARE	Domain	183	260	2.6e-25	88.8	SNARE domain
`XP_057773706.1`	Pfam	`PF14523`	Syntaxin_2	Domain	26	162	1.9e-36	125.7	Syntaxin-like protein
`XP_057773706.1`	Pfam	`PF05739`	SNARE	Domain	182	259	2.5e-25	88.8	SNARE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917722.1
GGAGAGCGGGATTCAAACTTGTAGGCGCAAGTTGAAGATGATCTCTGCCGCGGAGGTGGAGCCCACTACCGTCTATGATACACGTGTCAGACACAAGAGGCAGCCGGCATCCACCACATAATGCTGCTCTAAATCATTCTGTCGTTGTCTCTCTCTCTCTCTTCCCCCGCAATTTGATCAAACGATTCTCTTTTTTTTTTTGGGAGTAAAAAAGATAATCGAGAAGGAGAGCGAAACCAAACTTTCTCTTTTCTTCCTCC...

XM_057917723.1
GGAGAGCGGGATTCAAACTTGTAGGCGCAAGTTGAAGATGATCTCTGCCGCGGAGGTGGAGCCCACTACCGTCTATGATACACGTGTCAGACACAAGAGGCAGCCGGCATCCACCACATAATGCTGCTCTAAATCATTCTGTCGTTGTCTCTCTCTCTCTCTTCCCCCGCAATTTGATCAAACGATTCTCTTTTTTTTTTTGGGAGTAAAAAAGATAATCGAGAAGGAGAGCGAAACCAAACTTTCTCTTTTCTTCCTCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993001
ATGAGTTTTCAAGATCTAGAAGCGGGTCGTGGAAACGGCTTGCGAAGGGGGTACGTCAATGGTAAGCAGGACCCGACGCAGGCGGTGGCGTCCGGAATTTTTCAGATCAACACGGCGGTTTCCTCATTCCAGCGCCTGGTTAATACTCTGGGGACCCCCAAGGACACGCCAGAGCTTCGGGAAAAGCTGCGTAAAACTCGGCTACATATTGGGCAGCTGGTGAAGGATACCTCAGATAAACTTAAACAAGCTAGTGAAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773705.1
MSFQDLEAGRGNGLRRGYVNGKQDPTQAVASGIFQINTAVSSFQRLVNTLGTPKDTPELREKLRKTRLHIGQLVKDTSDKLKQASEIDHHVEVSASKKITDAKLAKDFQAVLKEFQKAQRLAAERETAYTPFISQAVLPSSSYSASDVDIRADKTPEQRSQLLESRRQEVVLLDNEIAFNEAIIEEREQGIEEIQQQIGEVNEIFKDLAVLVHEQGTMIDDIGSHIEGAHAATGQGKSQLLKAAKMQKSNSSLTCLLLVI...

XP_057773706.1
MSFQDLEAGRGNGLRRGYVNGKQDPTQAVASGIFQINTAVSSFQRLVNTLGTPKDTPELREKLRKTRLHIGQLVKDTSDKLKQASEIDHHVEVSASKKITDAKLAKDFQAVLKEFQKAQRLAAERETAYTPFISQAVLPSSYSASDVDIRADKTPEQRSQLLESRRQEVVLLDNEIAFNEAIIEEREQGIEEIQQQIGEVNEIFKDLAVLVHEQGTMIDDIGSHIEGAHAATGQGKSQLLKAAKMQKSNSSLTCLLLVIF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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