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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000133`

染色体: Chr07 坐标: 788300-789816 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000133`
名称	SmilChr07G000133
描述	uncharacterized SmilChr07G000133
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	788300 - 789816 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993003`
GeneID	`130993003`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993003`
原始查询	`LOC130993003`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835743]; symbol=AT5G56420; hit=AT5G56420; species=arabidopsis; confidence=low
产物	F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835743]; symbol=AT5G56420; hit=AT5G56420; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G56420` (AT5G56420) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835743] identity=28.3; qcov=0.549; evalue=1.21e-06; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993003

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773708.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057773708.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773708.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773708.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773708.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:788302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B39,B96
`Chr7:788338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B39,B96,C3,C69
`Chr7:788382`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	103	A11,A19,A20,A23,A25,A3,A4,A5,A8,B1,B107,B110,B111,B117,B12,B121,B125,B129,B130,B131,B134,B137,B138,B139,B15,B17,B18,B19,B21,B22,B25,B27,B29,B31,B33,B37,B44,B45,B46,B5,B51,B52,B54,B55,B58,B59,B64,B66,B7,B72,B75,B77,B8,B81,B83,B85,B86,B9,B90,B92,B97,B98,C12,C15,C16,C17,C2,C20,C28,C29,C30,C32,C34,C36,C37,C40,C42,C44,C48,C53,C54,C56,C58,C59,C60,C62,C64,C66,C68,C70,C71,C72,C73,C74,C79,C86,C87,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr7:788402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C86
`Chr7:788443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:788480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,C23,C41,C8
`Chr7:788527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,C10,C63
`Chr7:788530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B1,B30,C19
`Chr7:788530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B30,C19
`Chr7:788532`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	56	A1,A16,A2,A24,A6,A9,B1,B11,B114,B117,B120,B122,B132,B133,B15,B17,B21,B22,B24,B25,B26,B29,B3,B38,B49,B53,B55,B6,B61,B65,B7,B79,B80,B90,B92,B95,B97,C12,C14,C23,C35,C38,C42,C43,C47,C51,C57,C62,C65,C67,C71,C8,C81,C82,D3,D8
`Chr7:788586`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A14,A2,B118,B13,B134,B137,B139,B140,B47,B48,B76,B85,C10,C24,C33,C39,C46,C63,C76,C80,D11,D3,D6
`Chr7:788609`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	102	A19,A20,A23,A25,A3,A4,A5,A8,B100,B105,B110,B117,B12,B121,B125,B129,B130,B131,B138,B15,B17,B18,B19,B21,B22,B25,B27,B31,B33,B37,B44,B46,B51,B52,B54,B55,B58,B59,B64,B66,B7,B75,B77,B78,B8,B81,B82,B83,B86,B9,B90,B92,B97,B98,C12,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C22,C24,C28,C29,C30,C32,C33,C34,C36,C37,C4,C40,C42,C43,C44,C48,C53,C54,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C66,C68,C71,C72,C73,C74,C75,C79,C83,C86,C87,D10,D4,D5,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773708.1

315 aa

158

315

LRR_At5g56370

PF24758 LRR_At5g56370 77-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773708.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	77	188	7.5e-07	29.8	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917725.1
ATGACTGATGTTGTTAGGACAACGATTCTATCGAAGTGCTGGAAAAACCTTTGGACCGCCGCACACTACCTTAATTTCGACAACTATGATATGATGTTTATTCATTCTACACAGCTTGAAAACTTCGTTAATCGGGTCTTATTGCGCTGGAATGGGGTAAGGGTTCTGAAATTCAAGGTTGAATCGTATTTTGAGTTTCATGATTCAGTTTATGCGGATGCTAAATTGTGGGTGCATTTTGCCAAGCATAATCTAGCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993003
ATGACTGATGTTGTTAGGACAACGATTCTATCGAAGTGCTGGAAAAACCTTTGGACCGCCGCACACTACCTTAATTTCGACAACTATGATATGATGTTTATTCATTCTACACAGCTTGAAAACTTCGTTAATCGGGTCTTATTGCGCTGGAATGGGGTAAGGGTTCTGAAATTCAAGGTTGAATCGTATTTTGAGTTTCATGATTCAGTTTATGCGGATGCTAAATTGTGGGTGCATTTTGCCAAGCATAATCTAGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773708.1
MTDVVRTTILSKCWKNLWTAAHYLNFDNYDMMFIHSTQLENFVNRVLLRWNGVRVLKFKVESYFEFHDSVYADAKLWVHFAKHNLAEELYLHMGLYIEDDFMCRHGWVSPQCLYSCSSLKVLSVENCYFSINGNVQWNQLKSLTITEGIGLTEDAINRILCGSPQLEVLGAMIEGCMNSSSPNGKLLQFRFYCNKVVVTIEIFPLSKKLVIKVERRRYEDSIWAEPNIYREFEENLPMAFVLQLMTVEYILVEGDIIFPC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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