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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000175`

染色体: Chr07 坐标: 1101330-1105769 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000175`
名称	SmilChr07G000175
描述	uncharacterized SmilChr07G000175
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1101330 - 1105769 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993014`
GeneID	`130993014`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993014`
原始查询	`LOC130993014`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834593]; symbol=AT5G45570; hit=AT5G45570; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834593]; symbol=AT5G45570; hit=AT5G45570; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G45570` (AT5G45570) Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834593] identity=27.2; qcov=0.222; evalue=6.13e-09; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF09331 (DUF1985)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993014

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773718.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057773718.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773718.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773718.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773718.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1102566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr7:1102619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C53
`Chr7:1104642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr7:1104680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B78
`Chr7:1104680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr7:1104695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr7:1105155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr7:1105521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	43	A1,A18,B108,B111,B117,B119,B12,B122,B130,B139,B16,B2,B20,B27,B3,B30,B4,B41,B48,B49,B56,B57,B58,B64,B69,B7,B72,B74,B95,C17,C30,C38,C4,C46,C50,C51,C52,C64,C66,C72,C75,C77,D5
`Chr7:1105544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr7:1105591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,C3,C46,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773718.1

1046 aa

523

1046

DUF1985

Peptidase_C48

PF09331 DUF1985 100-232 aa PF02902 Peptidase_C48 815-1030 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773718.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	100	232	2e-11	44.7	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057773718.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	815	1030	1.1e-16	62.0	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917735.1
GAGTTTTTAAATACCAAAAATTAAAAAAGATAACTCTTTTAGCCTCAACTTAAAAACAACTCTTTTGTATACCAAAATCAGTTAAAAGACTAAAATACCCTTACATTATATCATTAAAGAAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGAAGTCATCGGCCCCTCCTCTCTCCTCCCTCCACCCCCAAATTCAAATTCTCTCTCTCTCTCCCAACTCACGACACGCTCACGACCGGCGCCACCTCACGATCGAATTCCAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993014
ATGGGCGACCGCGACCGGAACGACGACGACTCGGTGTCGGCGACAAGCTCCGAAGAGGAGGAGCGTCTCGCACATCCTACTCCTCCGATTAATTGTGATTGGAAAAGGCCTACATTGATCTACGTGACCCGTGGAGTTAATCTTTATATGAGGACCGATATATTGAAGGAGGTCAAGAATGTTTTACTTGATAAAGGCGGTCCGTTGGCTCTAGAGAGATTTAAAGAAGGCGTAGTAGGACGGTTGATTGATATCAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773718.1
MGDRDRNDDDSVSATSSEEEERLAHPTPPINCDWKRPTLIYVTRGVNLYMRTDILKEVKNVLLDKGGPLALERFKEGVVGRLIDIKRNHSASNALHHLLARQLKGSDIPCDESWFQVGGQTIRFRPTEYALVTGLHFGNSDFDPYAKHKPPRNGIFNRFFNGVSTKVHVLRKRFNEKSLGKDVEDYLKAANLLVYYLFLLCRDNPVIEDWAWTLVEDFERWDAFPWGSYTYGALSYYIDTVGIAPDQAEKDYHFYGPVWA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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