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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000261`

染色体: Chr07 坐标: 1675671-1676924 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000261`
名称	SmilChr07G000261
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1675671 - 1676924 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993023`
GeneID	`130993023`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993023`
原始查询	`LOC130993023`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT3G16210` (AT3G16210) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820867] identity=26.8; qcov=0.688; evalue=1.49e-18; confidence=low
Rice	`Os05g0177400` (OsFbox253) - identity=27.8; qcov=0.751; evalue=6.8e-15; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993023

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057773726.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057773726.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057773726.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773726.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773726.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1675692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C74
`Chr7:1675790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,B75,B99,C15
`Chr7:1675971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,C29,C3,C56,D7
`Chr7:1676042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:1676105`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C46
`Chr7:1676105`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C46
`Chr7:1676165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr7:1676216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B65,B76,B87
`Chr7:1676260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:1676352`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B3,B4,C12,C15,C21,C42
`Chr7:1676443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C70,D1
`Chr7:1676616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773726.1

417 aa

208

417

F-box-like

F-box

FBA_1

PF12937 F-box-like 25-61 aa PF00646 F-box 25-64 aa PF07734 FBA_1 104-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773726.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	25	61	1.1e-07	32.3	F-box-like
`XP_057773726.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	25	64	5.1e-09	36.4	F-box domain
`XP_057773726.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	104	257	1.6e-21	77.4	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917743.1
ATGCCTCCCAAGAGAACCCTCAATCGCTCAAACCAGAACAAGCAAGCGGCGGAGATCAACGCCATGGCCGACTGCAACTTACCCCGCGACATCATGATCGCCGTCTTGGCGCGGCTGCCGGTGAAATCTCTCTGCCGCTTCAAATGCGTATGCAAACCGTGGCTCCGCCTCGTCTCGAATCCAGATTTCGTGAAGATTCACACGGATCTGTCGCCGAGAGCGAGAGCCCCCGCCGCCCTAACCCATCTCCTCACATGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993023
ATGCCTCCCAAGAGAACCCTCAATCGCTCAAACCAGAACAAGCAAGCGGCGGAGATCAACGCCATGGCCGACTGCAACTTACCCCGCGACATCATGATCGCCGTCTTGGCGCGGCTGCCGGTGAAATCTCTCTGCCGCTTCAAATGCGTATGCAAACCGTGGCTCCGCCTCGTCTCGAATCCAGATTTCGTGAAGATTCACACGGATCTGTCGCCGAGAGCGAGAGCCCCCGCCGCCCTAACCCATCTCCTCACATGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773726.1
MPPKRTLNRSNQNKQAAEINAMADCNLPRDIMIAVLARLPVKSLCRFKCVCKPWLRLVSNPDFVKIHTDLSPRARAPAALTHLLTCPVLGILPNKVSPIEADHPYEIFLDHCNGLVCMGHPALTDRVVLWNPATNFWKILPHSGANFGAVRIVSLGFGCNAEGDDFKVVRISCLKGKKLKVGVEVYSSKSNSWRVLDDVGIRFRVKYPKNHVIVNGDPYWDACFAERLGENGEVEEGCALLGFDSTNMKFKFLPLPNLGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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