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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003353`

染色体: Chr01 坐标: 52283081-52286271 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003353`
名称	SmilChr01G003353
描述	probable protein phosphatase 2C 11
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52283081 - 52286271 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993031`
GeneID	`130993031`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993031`
原始查询	`LOC130993031`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein phosphatase 2C 11
产物	probable protein phosphatase 2C 11
Arabidopsis	`AT1G43900` (AT1G43900) Protein phosphatase 2C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840989] identity=73.1; qcov=0.886; evalue=2.73e-147; confidence=high
Rice	`Os04g0659500` (OsPP2C45) - identity=63.3; qcov=0.863; evalue=2.35e-120; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0006470 (protein dephosphorylation); GO:0043169 (cation binding)
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C); PF13672 (PP2C_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993031

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057773737.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057773737.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057773737.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773737.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773737.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52283359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C56
`Chr1:52284232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B137,C16
`Chr1:52284961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:52285906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B67,C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773737.1

306 aa

153

306

PP2C

PP2C_2

PF00481 PP2C 60-297 aa PF13672 PP2C_2 104-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773737.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	60	297	4.8e-60	204.1	Protein phosphatase 2C
`XP_057773737.1`	Pfam	`PF13672`	PP2C_2	Family	104	275	3.3e-06	27.6	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917754.1
GCAATTTTATAATAAAAGAAAAAGGAAAAGAAAAGAGAAAAAAATTTGCATTATCCCGTAGTCTTAGCTGCCCCGCCCGTTAACTGTTTTAAGGATGAGCCCTCCAACTCCAACGTTTTTCTACAGAGAGAGAGAGACGATGAATGAAATATAGAAATCGATTTTATGGAATAAGGTTTTGTCCGAATGTACAATGAACACTGATCAAGATCGACACCAATCTCAGCGGCCGGTACCGCTCAAGGATGCGTCGCCGTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993031
ATGAACACTGATCAAGATCGACACCAATCTCAGCGGCCGGTACCGCTCAAGGATGCGTCGCCGTCGCCCGCGGCGGAGCCGCCGCCCAATTCAAATGCTCCGTCTAAAAATCCCGATGCCATCTTGAGCGGTGGTGGAACCAGCAATCTCACTAGAGATAAGAATGGAAGGATAAGTTATGGATATTCCAGTTTCAAGGGTAAACGTTCATCCATGGAGGATTATTACGAGATTCGGATATCAGAAGTGGATGGTCAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773737.1
MNTDQDRHQSQRPVPLKDASPSPAAEPPPNSNAPSKNPDAILSGGGTSNLTRDKNGRISYGYSSFKGKRSSMEDYYEIRISEVDGQMVALFGVYDGHGGFRTAEYLKKNLFNNLRSHPDFIKDTKLAIVEAFKQTDTEYLNEEKGQQKDAGSTASTAVLVQDKIFVANVGDSRVVASRAGSAIPLSIDHKPDRTDERERIEKAGGFIVWAGTWRVGGVLAVSRAFGDKLLRPYVVAEPEIQEEQIDGVDFLIIASDGLWN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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