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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000380`

染色体: Chr07 坐标: 2564461-2565690 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000380`
名称	SmilChr07G000380
描述	uncharacterized SmilChr07G000380
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2564461 - 2565690 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993034`
GeneID	`130993034`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993034`
原始查询	`LOC130993034`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826925]; symbol=AT4G13110; hit=AT4G13110; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826925]; symbol=AT4G13110; hit=AT4G13110; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G13110` (AT4G13110) BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826925] identity=44.6; qcov=0.565; evalue=4.63e-54; confidence=medium
Rice	`Os01g0273300` - identity=33.3; qcov=0.976; evalue=5.59e-47; confidence=low
GO	GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF03909 (BSD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993034

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057773738.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057773738.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057773738.1`
4	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057773738.1`
5	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057773738.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2564622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C55
`Chr7:2564623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B48,B66,C11,C46,C69
`Chr7:2564710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr7:2564746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B97,C5
`Chr7:2564902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:2564918`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B129
`Chr7:2564918`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B129
`Chr7:2564930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:2565061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B48,B66,C11,C46,C69
`Chr7:2565100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr7:2565118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B33,C16,C70,C8
`Chr7:2565333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773738.1

409 aa

204

409

BSD

PF03909 BSD 189-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773738.1`	Pfam	`PF03909`	BSD	Domain	189	245	1.3e-10	41.8	BSD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917755.1
ATGGACTTCTTCAAATCTGTCTTCTCGGAGCCCACCCCCACCCCCTCCCCCTCCCCCTCCCCCCCTACCACCCCCACCTCCCCAAACCCCTCTCCCACCCCTTCTTGGGGAATCGGATCCACCCTCCTCAAAACCATAGCCTCAAAATCCGAATCTTTAATCGACAACTACTACAAAGATCTCCAAGAATTCAGCTCCGGCTTCAAGAAGGAGACCGCCGTCATCCGCGAAGCCGCCAGCCGCGCCGTACAGGAACTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993034
ATGGACTTCTTCAAATCTGTCTTCTCGGAGCCCACCCCCACCCCCTCCCCCTCCCCCTCCCCCCCTACCACCCCCACCTCCCCAAACCCCTCTCCCACCCCTTCTTGGGGAATCGGATCCACCCTCCTCAAAACCATAGCCTCAAAATCCGAATCTTTAATCGACAACTACTACAAAGATCTCCAAGAATTCAGCTCCGGCTTCAAGAAGGAGACCGCCGTCATCCGCGAAGCCGCCAGCCGCGCCGTACAGGAACTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773738.1
MDFFKSVFSEPTPTPSPSPSPPTTPTSPNPSPTPSWGIGSTLLKTIASKSESLIDNYYKDLQEFSSGFKKETAVIREAASRAVQELPARLESGAAIAQESLEAVGQAIDNVGSTVSDIIGKDLNFAANDGHLDQGDDDSNVGVSAGRDDELGFSASVKPYSRIDAMVRAVQCDIRTYIDEVEESGYGEWRLGFGLEERRGEIEGLLGEKGAVAEIYGEVVPLKVDEEMFWCRYFYRVDRVVRAEEARLRMVKRAISGEEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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