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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000389`

染色体: Chr07 坐标: 2604542-2605654 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000389`
名称	SmilChr07G000389
描述	F-box protein At5g03100-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2604542 - 2605654 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993036`
GeneID	`130993036`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993036`
原始查询	`LOC130993036`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g03100-like
产物	F-box protein At5g03100-like
Arabidopsis	`AT4G00320` (AT4G00320) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827939] identity=28.3; qcov=0.554; evalue=7.53e-12; confidence=low
Rice	`Os05g0575400` (OsFbox283) - identity=28.7; qcov=0.527; evalue=4.11e-08; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993036

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773740.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773740.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773740.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773740.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773740.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2604626`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A21,B118,B131,B72,B74,B76,C27,C34,C43,C46,C60,C70,D5
`Chr7:2604628`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A8
`Chr7:2604628`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A8
`Chr7:2604648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:2604670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B120,B36,C8,C87
`Chr7:2604676`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A11,B121,B140,C1,C63
`Chr7:2604676`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A11,B121,B140,C1,C63
`Chr7:2604679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr7:2604735`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	28	A16,B100,B123,B128,B134,B22,B27,B33,B34,B35,B37,B45,B55,B56,B62,B73,B80,B82,B85,B96,C16,C23,C27,C4,C56,C81,C84,D9
`Chr7:2604737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr7:2604757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B65,B95,C37
`Chr7:2604763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773740.1

370 aa

185

370

LRR_At5g56370

PF24758 LRR_At5g56370 125-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773740.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	125	201	1.8e-14	54.7	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917757.1
ATGGAGAATGCTCAGAAAAGAATTGCAGCAGATGGCGAATCCAAACTTCCAGAAGAAATCATTGAGCACATACAATCTCTTATAACTGATCAAAGAGATGCTGCTCGAACCTCTCTCCTATCCAAGTCCTGGCACGACGCGTGGTTCACGCGTCCCAACCTCAGTCTCGATCAAACCAAGTTCCGGAATCGCATAGATGAGTTTCCCATATTCACGAAGAAGACTATGCAGAGGTATGAAGATTTGAATCGAAATATTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993036
ATGGAGAATGCTCAGAAAAGAATTGCAGCAGATGGCGAATCCAAACTTCCAGAAGAAATCATTGAGCACATACAATCTCTTATAACTGATCAAAGAGATGCTGCTCGAACCTCTCTCCTATCCAAGTCCTGGCACGACGCGTGGTTCACGCGTCCCAACCTCAGTCTCGATCAAACCAAGTTCCGGAATCGCATAGATGAGTTTCCCATATTCACGAAGAAGACTATGCAGAGGTATGAAGATTTGAATCGAAATATTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773740.1
MENAQKRIAADGESKLPEEIIEHIQSLITDQRDAARTSLLSKSWHDAWFTRPNLSLDQTKFRNRIDEFPIFTKKTMQRYEDLNRNIKIFKLCLLGGTHDSVGRELILKAIKLGATDLTIEFPTSDKSRCFVLPDEVLESETLVRLSVLGLTIDLERRNKAVACSNLKFLKLTHASVNGDLVRDLISRCPSIEELTVIHTTSTSTTTTSSFGNERRRWSPSHNQFDNLKCLRLISLGVKLHDYEELWNKSPSLKVLVIWDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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