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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003423`

染色体: Chr01 坐标: 52885606-52887889 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003423`
名称	SmilChr01G003423
描述	ethylene-responsive transcription factor ERF110-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52885606 - 52887889 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993041`
GeneID	`130993041`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993041`
原始查询	`LOC130993041`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ethylene-responsive transcription factor ERF110-like
产物	ethylene-responsive transcription factor ERF110-like
Arabidopsis	`AT5G13330` (Rap2.6L) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831174] identity=50.7; qcov=0.471; evalue=6.93e-33; confidence=medium
Rice	`Os12g0168100` (DERF8) - identity=45.5; qcov=0.68; evalue=1.24e-33; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009873 (ethylene-activated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993041

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773746.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773746.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773746.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773746.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773746.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52886416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C37
`Chr1:52887239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B102
`Chr1:52887314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr1:52887318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr1:52887428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B41,B6,B8,C28
`Chr1:52887506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr1:52887521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr1:52887564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C10,C27,C3,C45,C50
`Chr1:52887575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C74
`Chr1:52887592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C62,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773746.1

297 aa

148

297

AP2

PF00847 AP2 118-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773746.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	118	167	8.5e-15	55.5	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917763.1
CAATTAAAGGGTGTGAACCTGTATAGATTCGAAGTCGTCTACAAGCCTCATATTTCTTTTTCCTTCTAATTTCTATCGACATAAAATAATTAAATCAAATAAATAAAATATTTTCTGCCATGTATGCAGTTCCAATTTGAGCACATTTAATTTAAAAACTACTGTTCCTAAAACGGCTGTAGCTATTCTCTGAATCTCTGCATCCAGTCTATATTCCTTCTATATAGTCCCATTTTTTTTTTTTTTTGAGAATAAAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993041
ATGGCTTCTCCCTCAATGACCGAGATGTCGGCTATGGTGACAGCGCTGACCCACGTGGTGTCTAGTCAGCCGCAAAACGGCGGCGGAATCTCGTCGTCTTATGGTGGTGGGGATTTTGTCCAAGCCTCCATTAATTCTCCTTCCTCTGCTTACTCGTCTTCGAGTTCCGCCTCGGCTAGCGGCCGGAAAAGGAGGCACGATCGACAGGATTGCGCGGCCGAGTTTTCTGAGAATTTTTATTCGTTTAGAGCTGCTAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773746.1
MASPSMTEMSAMVTALTHVVSSQPQNGGGISSSYGGGDFVQASINSPSSAYSSSSSASASGRKRRHDRQDCAAEFSENFYSFRAAKSEPAAAAAEQTPPPESSSYTASYPETGERRRRYIGVRQRPWGKWAAEIRDPQKAARVWLGTFNTAEDAARAYDEAALRFRGRRAKLNFPENVRILPPPQPSQYSTQFTISAPPPPPTAAAPQQSFFQTAGSDYLEYSELLGSRGDLQLGHPPATLFENMLYASSLAGLYSHYSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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