当前解析结果
SmilChr07G000436| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000436 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000436 |
| 描述 | cold and drought-regulated protein CORA-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 3055954 - 3056403 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993048 |
|---|---|
| GeneID | 130993048 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993048 |
| 原始查询 | LOC130993048 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cold and drought-regulated protein CORA-like |
| 产物 | cold and drought-regulated protein CORA-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993048 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057773751.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057773751.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773751.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773751.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057773751.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:3056004 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B6,B97,C67,C9,D1 |
Chr7:3056188 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B1,B33,B35,C38 |
Chr7:3056212 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B127,B13,B66,B98,C45 |
Chr7:3056257 |
A |
ACC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 21 | B123,B137,B139,B29,B35,B56,B77,B96,C10,C14,C21,C26,C37,C39,C49,C52,C60,C63,C64,C72,C80 |
Chr7:3056259 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 22 | B123,B137,B139,B29,B35,B56,B77,B96,C10,C14,C21,C26,C35,C37,C39,C49,C52,C60,C63,C64,C72,C80 |
Chr7:3056280 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 6 | C21,C35,C37,C49,C63,C72 |
Chr7:3056304 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 89 | A10,A13,A15,A18,A21,A25,A4,A6,A7,B101,B102,B104,B11,B111,B114,B117,B119,B120,B123,B126,B130,B131,B140,B17,B23,B3,B31,B34,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B48,B5,B50,B53,B58,B6,B61,B62,B64,B65,B7,B73,B75,B76,B8,B83,B84,B89,B94,B97,C10,C18,C2,C27,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C40,C41,C45,C46,C47,C48,C52,C57,C60,C62,C63,C67,C75,C78,C8,C82,C84,C85,C9,D11,D2,D7 |
Chr7:3056307 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 18 | B118,B123,B137,B139,B29,B35,B36,B56,B77,B96,C10,C14,C26,C39,C52,C60,C64,C80 |
Chr7:3056374 |
ACC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 8 | B102,B111,B17,B6,C18,C7,C76,C84 |
Chr7:3056378 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | B102,B111,B17,B6,C18,C7,C76,C84 |
Chr7:3056380 |
GTC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 8 | B102,B111,B17,B6,C18,C7,C76,C84 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。