当前解析结果
SmilChr07G000493| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000493 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000493 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000493 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 3432948 - 3434481 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993059 |
|---|---|
| GeneID | 130993059 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993059 |
| 原始查询 | LOC130993059 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=37; qcov=0.463; evalue=3.19e-41; confidence=medium |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993059 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057773761.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057773761.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773761.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057773761.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057773761.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:3433063 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B11,B17 |
Chr7:3433230 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B22,B23,B63 |
Chr7:3433283 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B31,B90,C53 |
Chr7:3433388 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C30 |
Chr7:3433518 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | B10,B100,B101,B130,B133,B16,C14,C50,C67,C86,D1 |
Chr7:3433703 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A25,B12,B120,C46 |
Chr7:3433719 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C46 |
Chr7:3433719 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr7:3433743 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,B51 |
Chr7:3433756 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B59 |
Chr7:3433776 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B41,D7 |
Chr7:3433802 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B101,B51,C18,C85,D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。