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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000517`

染色体: Chr07 坐标: 3631170-3634099 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000517`
名称	SmilChr07G000517
描述	putative F-box protein At1g49610
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3631170 - 3634099 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993065`
GeneID	`130993065`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993065`
原始查询	`LOC130993065`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At1g49610
产物	putative F-box protein At1g49610
Arabidopsis	`AT3G26922` (AT3G26922) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922367] identity=30.5; qcov=0.536; evalue=1.81e-22; confidence=low
Rice	`Os10g0128200` (OsFbox517) - identity=24.4; qcov=0.752; evalue=1.54e-14; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993065

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773770.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057773770.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773770.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773770.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773770.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3631194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr7:3631219`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B119
`Chr7:3631219`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B119
`Chr7:3631234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B87,C52
`Chr7:3631241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr7:3631260`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B109,B121,B128,B2,B37,B38,B39,B40,B57,B91
`Chr7:3631275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:3631307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,C64,C66,C78
`Chr7:3631323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B87,C52
`Chr7:3631381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B87,C52
`Chr7:3631390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:3631438`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	72	A1,A13,A19,A22,A23,A25,A7,B107,B112,B113,B118,B126,B128,B129,B132,B134,B136,B138,B20,B22,B23,B25,B29,B3,B35,B42,B43,B46,B47,B50,B59,B68,B70,B71,B8,B82,B86,B91,B95,B99,C15,C17,C20,C21,C22,C24,C26,C29,C30,C31,C39,C4,C41,C42,C43,C55,C58,C62,C64,C66,C70,C77,C78,C8,C80,C81,C84,C9,D1,D10,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773770.1

556 aa

278

556

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 27-64 aa PF24758 LRR_At5g56370 107-246 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773770.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	27	64	3.2e-07	30.7	F-box domain
`XP_057773770.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	107	246	3.6e-09	37.4	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917787.1
CAAAGAACGTTTCAACCTTTTATCTTTTATGTTTTCTTCTTCTCCCTTCAAAAGCATAATACTAGTATATTTTACCCATTTACAGTAGGGCTTTCCCATGAAATTTGTCTTTCTCTTGATCGAAACTATACTACCACTGCTCATTTAATTCCAAGAATGAGTGAAACAATGGATGAATGGCACGTTTCTCAAAGTGATGAAGATTACGGAGCTGCAGAAGCACACAGCGACCGACTCAGTGATTTACCCGACTCTTTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993065
ATGAGTGAAACAATGGATGAATGGCACGTTTCTCAAAGTGATGAAGATTACGGAGCTGCAGAAGCACACAGCGACCGACTCAGTGATTTACCCGACTCTTTAATTCTCACCATTCTTTTGTTGTTGGATATGAGAGATGTTGTTCGGACATCCCTTCTCTCCCAACGTTGGAGAAATCTCTGGTCCACCATCCCCTGCCTTGATTTCTTCGAACAAACTCCAACTATTATATCTAGTGTTCTTGCACAATGGAAAGGTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773770.1
MSETMDEWHVSQSDEDYGAAEAHSDRLSDLPDSLILTILLLLDMRDVVRTSLLSQRWRNLWSTIPCLDFFEQTPTIISSVLAQWKGPKILKFCLSFPRYIVGPSSVIDSWLLFAIEKHVGELFLYFSYWRDVDSNGKGRYCLPQPLYSCSSITKLTLLSCKLRIEDNVQWNQLKRLEIRYPDGLSGDAMNQVLMGAPRLEELVLCSFEISENFIIQSISLKMLKIETDCVWPQTIVMRIWAPNLLAFKIDASFHGNCLLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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