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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000554`

染色体: Chr07 坐标: 3813308-3816574 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000554`
名称	SmilChr07G000554
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.13-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3813308 - 3816574 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993074`
GeneID	`130993074`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993074`
原始查询	`LOC130993074`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.13-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.13-like
Arabidopsis	`AT1G69870` (NRT1.7) nitrate transporter 1.7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843323] identity=54.5; qcov=0.881; evalue=6.41e-60; confidence=high
Rice	`Os01g0913300` (OsNRT1.7) - identity=59.6; qcov=0.881; evalue=8.04e-60; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993074

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057773779.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057773779.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057773779.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773779.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773779.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3813309`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B124,B18
`Chr7:3813309`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B124,B18
`Chr7:3813312`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B119,B124,B18,B61
`Chr7:3813312`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B119,B124,B18,B61
`Chr7:3813460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B61
`Chr7:3816155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B75,B97,C54,C82,D4
`Chr7:3816179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr7:3816191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B78,C19,C29,C62,C85
`Chr7:3816192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B138,B44,B8,C51
`Chr7:3816225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,D7
`Chr7:3816230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr7:3816239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773779.1

177 aa

177

PTR2

PF00854 PTR2 2-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773779.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	2	139	9.1e-28	98.0	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917796.1
ATGATCACGGTGGCGCTATGGATCCCCGTGTACGACCGGGTGGTGGTGCCGTCCGTGAGGAAGGTCACCAAGGTGGAAGGTGGCATCACCTTGCTCCAGAGGATGGGGATCGGGCTGGTGTTCTCCATCCTCTCGATGGTAGTGTCCGGCCTGGTCGAGCGGATGAGAAGGGCCTCTGCCCTAGCTCACGCTGGACCAGTCGGGACCACTACCCTAACGGTCTTCTGGCTGGCCCCGCAGCTGATGCTGATGGGGTTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993074
ATGATCACGGTGGCGCTATGGATCCCCGTGTACGACCGGGTGGTGGTGCCGTCCGTGAGGAAGGTCACCAAGGTGGAAGGTGGCATCACCTTGCTCCAGAGGATGGGGATCGGGCTGGTGTTCTCCATCCTCTCGATGGTAGTGTCCGGCCTGGTCGAGCGGATGAGAAGGGCCTCTGCCCTAGCTCACGCTGGACCAGTCGGGACCACTACCCTAACGGTCTTCTGGCTGGCCCCGCAGCTGATGCTGATGGGGTTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773779.1
MITVALWIPVYDRVVVPSVRKVTKVEGGITLLQRMGIGLVFSILSMVVSGLVERMRRASALAHAGPVGTTTLTVFWLAPQLMLMGFAEAFNIIGQIEFYNKEFPENMTSLANSLFSCTMAGASYISAALVNIVHHTTAKRAHPDWLTKDINQGRLENLEMELNSSMPSSSLIDQQVF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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