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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000560`

染色体: Chr07 坐标: 3850323-3851373 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000560`
名称	SmilChr07G000560
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3850323 - 3851373 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993075`
GeneID	`130993075`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993075`
原始查询	`LOC130993075`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=26.4; qcov=1.15; evalue=2.11e-10; confidence=low
Rice	`Os02g0191000` - identity=26.4; qcov=0.889; evalue=4.02e-13; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993075

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057773780.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057773780.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057773780.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773780.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773780.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3850339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B24,B29,C20,C24,C69
`Chr7:3850339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B29,C20,C24,C69
`Chr7:3850345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C69,D2
`Chr7:3850435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B91
`Chr7:3850528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B82,B86,B91,C9
`Chr7:3850538`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D5
`Chr7:3850538`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D5
`Chr7:3850544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B82,B91,C9
`Chr7:3850575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C62
`Chr7:3850575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr7:3850620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B40,B71,C42
`Chr7:3850632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773780.1

333 aa

166

333

LRR_14

PF23598 LRR_14 75-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773780.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	75	314	7.7e-15	55.2	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917797.1
ATGAGGGATTTATGCTTGAAGAAAGCAGAACATGAAAGATTTGTGCATGTTAAGAACAAGCTAGTTGGAAAGGTCGAGAAAGATTCAGTGTACAGCCTACGCCGTGTGAGTGTGCATCCGTCTTATCGCATCAGAGATGTGTATGCTTCGGAAGAGTTGATGTCGTTTGCCCGTTCTTTTCTTTGCACTTGTGTTGCATCACGTGATGTTCTATCTTCTGTGTTTTTTGGTCTGAGAATGCTGAGGGTATTGGACATAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993075
ATGAGGGATTTATGCTTGAAGAAAGCAGAACATGAAAGATTTGTGCATGTTAAGAACAAGCTAGTTGGAAAGGTCGAGAAAGATTCAGTGTACAGCCTACGCCGTGTGAGTGTGCATCCGTCTTATCGCATCAGAGATGTGTATGCTTCGGAAGAGTTGATGTCGTTTGCCCGTTCTTTTCTTTGCACTTGTGTTGCATCACGTGATGTTCTATCTTCTGTGTTTTTTGGTCTGAGAATGCTGAGGGTATTGGACATAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773780.1
MRDLCLKKAEHERFVHVKNKLVGKVEKDSVYSLRRVSVHPSYRIRDVYASEELMSFARSFLCTCVASRDVLSSVFFGLRMLRVLDIIEIKFPQFPTEILHIFNLRYLAFSFDSKQLPSYISRLWNLQTLVICSASIKYVPAEIWQMAELRHVKFYDAYVEESDWRGLVLEKLQSISTISDPSVRFLGRIPNIKYLGIESLHQFDLSHLHKLETLKFSCYSSSTPVSLTEFRLPPSVRNLSFTRCEIAVEFMEYLCEELPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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