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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000637`

染色体: Chr07 坐标: 4297406-4299952 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000637`
名称	SmilChr07G000637
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4297406 - 4299952 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993086`
GeneID	`130993086`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993086`
原始查询	`LOC130993086`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=27.8; qcov=1.05; evalue=5.14e-73; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=29; qcov=0.962; evalue=8.8e-81; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993086

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057773793.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057773793.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773793.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773793.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773793.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4297541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr7:4297778`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A14,A3,B100,B103,B129,B138,B140,B31,B49,B68,C15,C27,C29,C36,C38,C39,C40,C72
`Chr7:4297821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr7:4297867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr7:4298023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr7:4298173`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A10,A18,A23,A3,A8,B108,B119,B12,B140,B21,B44,B55,B60,B99,C29,C37,C50,C51,C83,C87,D8
`Chr7:4298190`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B87,D6
`Chr7:4298190`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B87,D6
`Chr7:4298256`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D2
`Chr7:4298256`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D2
`Chr7:4298278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:4298316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773793.1

848 aa

424

848

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 145-318 aa PF23559 WHD_DRP 402-465 aa PF23598 LRR_14 535-763 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773793.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	145	318	2.6e-40	138.5	NB-ARC domain
`XP_057773793.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	402	465	2.1e-11	44.4	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057773793.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	535	763	3.1e-13	49.9	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917810.1
ATGGCTTACAATCTAAAATCTCTCATAAAGATTCTACAAGAAACCCTGAACCCTGATGTAGAGCGCTGGAATTTTGACCATGTCAAACCACAGCTAATATCCCTCCTTGAAATAGCAGCTTCTCTGAAGCAGATTCTTGAAACCCCTATTATGGAAAGCAGCCCCGAAACGGAAAGATTAGAGAGTGAAATCCGAGATGCAACACATGAAGCAGAGGACATCATCGAATCCCATATGGTCGATCAGATCATCCCTGAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993086
ATGGCTTACAATCTAAAATCTCTCATAAAGATTCTACAAGAAACCCTGAACCCTGATGTAGAGCGCTGGAATTTTGACCATGTCAAACCACAGCTAATATCCCTCCTTGAAATAGCAGCTTCTCTGAAGCAGATTCTTGAAACCCCTATTATGGAAAGCAGCCCCGAAACGGAAAGATTAGAGAGTGAAATCCGAGATGCAACACATGAAGCAGAGGACATCATCGAATCCCATATGGTCGATCAGATCATCCCTGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773793.1
MAYNLKSLIKILQETLNPDVERWNFDHVKPQLISLLEIAASLKQILETPIMESSPETERLESEIRDATHEAEDIIESHMVDQIIPEGSSSKIHPPQILEQLIQKLHSVKELVMKIMDGNQISTSASASAVASSSPAKNTVVGLDQDLMQLMDRLTGHGRKLEIIPIVGMGGIGKTTLARTLYDDQAIVSHFDICGWTTISQDRNVRSILLSLLSCIYKDRITPDLLQEEDYELEDDIYKILYGRRYLIVLDDMWGAHSWD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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