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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000681`

染色体: Chr07 坐标: 4626141-4626599 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000681`
名称	SmilChr07G000681
描述	mitochondrial metalloendopeptidase OMA1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4626141 - 4626599 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993093`
GeneID	`130993093`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993093`
原始查询	`LOC130993093`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial metalloendopeptidase OMA1-like
产物	mitochondrial metalloendopeptidase OMA1-like
Arabidopsis	`AT5G51740` (AT5G51740) Peptidase family M48 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835248] identity=35; qcov=1.18; evalue=1.67e-28; confidence=medium
Rice	`Os02g0735100` - identity=30.2; qcov=1.24; evalue=1.55e-20; confidence=low
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0016020 (membrane); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	-
Pfam	PF01435 (Peptidase_M48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993093

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057773799.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057773799.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773799.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773799.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773799.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4626151`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr7:4626151`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr7:4626162`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B13
`Chr7:4626162`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B13
`Chr7:4626172`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr7:4626172`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr7:4626296`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C28
`Chr7:4626296`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C28
`Chr7:4626300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:4626360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr7:4626439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B140,B72
`Chr7:4626463`	`AGC`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B31,C2,C26,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773799.1

152 aa

152

Peptidase_M48

PF01435 Peptidase_M48 96-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773799.1`	Pfam	`PF01435`	Peptidase_M48	Domain	96	150	1.3e-11	45.4	Peptidase family M48

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917816.1
ATGAGACGCCAATTCATGCTCCTCTCGAGCTCTCGCGACAGACGGCTAGGCGAGGCGTGGTTCGAGGCAATCAAATCGGAATACAAACACAAAATAGTGCCCCCTGAAAACCCTAACAACATTAGGTTGCAGAAGCTAGGGCAGGAGATAGTTGAGGCCGCGCGCAAGGGGATACTGAAGCAGGCAGCCACGGCGAGGCCAGCGATGATGCTACCTCGTTATCAACACGAGAACATGATGATGAGGATGATCAAGGCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993093
ATGAGACGCCAATTCATGCTCCTCTCGAGCTCTCGCGACAGACGGCTAGGCGAGGCGTGGTTCGAGGCAATCAAATCGGAATACAAACACAAAATAGTGCCCCCTGAAAACCCTAACAACATTAGGTTGCAGAAGCTAGGGCAGGAGATAGTTGAGGCCGCGCGCAAGGGGATACTGAAGCAGGCAGCCACGGCGAGGCCAGCGATGATGCTACCTCGTTATCAACACGAGAACATGATGATGAGGATGATCAAGGCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773799.1
MRRQFMLLSSSRDRRLGEAWFEAIKSEYKHKIVPPENPNNIRLQKLGQEIVEAARKGILKQAATARPAMMLPRYQHENMMMRMIKAFSGKREFSHQSANLEGFKWEFVLVDEPHIVNAFCAPAGKIFVFTGLLNMFRDAAAIASVIGHEVYI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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