当前解析结果
SmilChr07G003857| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003857 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003857 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003857 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 47922329 - 47923935 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130993111 |
|---|---|
| GeneID | 130993111 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993111 |
| 原始查询 | LOC130993111 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993111 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057773846.1 |
| 2 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.60000 | XP_057773846.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057773846.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773846.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773846.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:47923455 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B140,B35,C32,C48,C68 |
Chr7:47923464 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B51 |
Chr7:47923464 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B51 |
Chr7:47923537 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B31,B7,C86 |
Chr7:47923605 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,B119,C31 |
Chr7:47923759 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 32 | A1,A13,A16,A18,A19,B102,B105,B125,B131,B22,B26,B28,B30,B45,B6,B63,B66,B83,C14,C18,C35,C40,C44,C56,C63,C65,C67,C76,C81,C9,D4,D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。