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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002095`

染色体: Chr07 坐标: 19078638-19080561 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002095`
名称	SmilChr07G002095
描述	probable glycosyltransferase At5g03795
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19078638 - 19080561 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993175`
GeneID	`130993175`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993175`
原始查询	`LOC130993175`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glycosyltransferase At5g03795
产物	probable glycosyltransferase At5g03795
Arabidopsis	`AT4G38040` (AT4G38040) Exostosin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829960] identity=36.5; qcov=0.786; evalue=1.58e-69; confidence=medium
Rice	`Os02g0187200` - identity=37.3; qcov=0.853; evalue=1.94e-72; confidence=medium
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03016 (Exostosin_GT47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993175

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057773934.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773934.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773934.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773934.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773934.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19078702`	`TAC`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A3,B33,B37,B65,C53
`Chr7:19078740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B45
`Chr7:19078742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B109,B130,C27,C78
`Chr7:19078746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C46,C78,C83
`Chr7:19078783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C27,C57
`Chr7:19078800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B45,B65,B73,D10
`Chr7:19078802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B99,C26,C75
`Chr7:19079130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:19079152`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	B111,B120,B34,B59,B61,B71,B79,C15,C17,C3,C34,C38,C55,C7,C71,C86,C9,D8,D9
`Chr7:19079212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C65,D10
`Chr7:19079245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B59,B79,C34,C86
`Chr7:19079246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,C5,D11,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773934.1

449 aa

224

449

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 115-397 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773934.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	115	397	1.7e-53	182.6	Exostosin GT47 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917951.1
ATAGTAGTGCCGTTGAAGAAGCAAGAATTTACAGTATTTTATTTTTAGAAGAACCAAGAATGTTTACTACATATAAAAAGTGGAGTGACACGCAAACCGAGGGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGTCTTCCACCACCGGAAGGAAGTTCCTCCGCCGCCATTAGCTGTAACTTAGAGAAAGAGGGCGTGATGAGTCTGTTGAGTATCTCAAGGCGAAAATGTTGGAATGCATATCTCATGATATTCTCACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993175
ATGTTTACTACATATAAAAAGTGGAGTGACACGCAAACCGAGGGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGTCTTCCACCACCGGAAGGAAGTTCCTCCGCCGCCATTAGCTGTAACTTAGAGAAAGAGGGCGTGATGAGTCTGTTGAGTATCTCAAGGCGAAAATGTTGGAATGCATATCTCATGATATTCTCACCCATCGCTCTCCTCTTGATCACATCTTCATCTATTTGGTCGCTGCGCCCTCAAATTCCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773934.1
MFTTYKKWSDTQTEGLSLSLSLSLRLPPPEGSSSAAISCNLEKEGVMSLLSISRRKCWNAYLMIFSPIALLLITSSSIWSLRPQIPDLKSSPPPPRSSPYHDWEFFNADYEEMLSKLRIYVYPDALNANTSSSAVFLPHPDPLNPKIGNYYSEHAFKLALLRSSLVTQRPNHAHFFFMPFSINIMRYHPLVRSESSISTFVANYVTKISSESAHWNASGGADHFFVCCHSVGREATSQHSALRNNAIQITCSSSYFQRLY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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