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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002112`

染色体: Chr07 坐标: 19238587-19244873 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002112`
名称	SmilChr07G002112
描述	uncharacterized SmilChr07G002112
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19238587 - 19244873 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993194`
GeneID	`130993194`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993194`
原始查询	`LOC130993194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP-5 complex subunit beta-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821524]; symbol=AT3G19870; hit=AT3G19870; species=arabidopsis; confidence=high
产物	AP-5 complex subunit beta-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821524]; symbol=AT3G19870; hit=AT3G19870; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G19870` (AT3G19870) AP-5 complex subunit beta-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821524] identity=49.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0829400` - identity=43.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0016197 (endosomal transport); GO:0030119 (AP-type membrane coat adaptor complex)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF21588 (AP5B1_middle); PF21590 (AP5B1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993194

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773963.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057773963.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057773963.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773963.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773963.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19238824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,C29,C54,C57
`Chr7:19238962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B101,C5,D11,D7
`Chr7:19238974`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A25
`Chr7:19238974`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A25
`Chr7:19238995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B101,C5,D11,D7
`Chr7:19239110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B95,C29,C54,C57
`Chr7:19239123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C57
`Chr7:19239235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B95,C29,C54,C57
`Chr7:19241615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:19241803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,D11
`Chr7:19241825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:19242236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B95,C29,C54,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773963.1

1125 aa

562

1125

AP5B1_middle

AP5B1_C

PF21588 AP5B1_middle 248-645 aa PF21590 AP5B1_C 1075-1121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773963.1`	Pfam	`PF21588`	AP5B1_middle	Repeat	248	645	5e-24	86.0	AP5B1, middle domain
`XP_057773963.1`	Pfam	`PF21590`	AP5B1_C	Domain	1075	1121	6.3e-11	43.6	AP5B1, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917980.1
TTTCATTTCATTTATGAATTTGAAAAAGAATATTGAATTTTAACGAAAAAAAAAAAAAAACAATTTCGCTACAGTCCTTCCGCATTACCGGATTTGAGAACACGTCCGTAATGAGAGAGGGATAATGAATTTATGATACACAGTGACAGCGATGGCCGGAACGCCGCCGAAATCCCTATCTCCGCCGGAATGGGACTCCCTAATCGACGAATACAATCTCGACGGCGCCGCCCGCCTCCATTTCTGGACAGGCGGCGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993194
ATGGCCGGAACGCCGCCGAAATCCCTATCTCCGCCGGAATGGGACTCCCTAATCGACGAATACAATCTCGACGGCGCCGCCCGCCTCCATTTCTGGACAGGCGGCGCATCCGTACTGGACCTCTGCCTATCCTCCCTCCTCCGCAAAGACATCCCTATCCAACTCAAGCTCAACATTCTCACTTTTATCGAGCACCACTCGCTCGAAGATTCGCCTCCACCGCCGCCTACCCTACTCCGCCTCCTCGACGCTCTCCGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773963.1
MAGTPPKSLSPPEWDSLIDEYNLDGAARLHFWTGGASVLDLCLSSLLRKDIPIQLKLNILTFIEHHSLEDSPPPPPTLLRLLDALRSVIQSPSDPFSLKDQFLISTTAVFVTSLSESDEFGGGAPPLCGLVELLLTIINRPNHGLDRHTRGVACECLRQLELAFPCLLSEIAPHLWSLCQSERTHVSQWYVLLLSTAILNIVKLKPSEASIASIGNATIPLVPFSLPQFLIDRVAADFVWKENEICYKELRKVVAFLLDC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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