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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002119`

染色体: Chr07 坐标: 19318260-19321304 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002119`
名称	SmilChr07G002119
描述	probable metal-nicotianamine transporter YSL7
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19318260 - 19321304 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993202`
GeneID	`130993202`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993202`
原始查询	`LOC130993202`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable metal-nicotianamine transporter YSL7
产物	probable metal-nicotianamine transporter YSL7
Arabidopsis	`AT1G65730` (YSL7) YELLOW STRIPE like 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842884] identity=62.2; qcov=0.948; evalue=7.1e-145; confidence=high
Rice	`Os04g0524600` (OsYSL12) - identity=62.7; qcov=0.914; evalue=1.13e-144; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0035673 (oligopeptide transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03169 (OPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993202

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057773984.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057773987.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057773987.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773984.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773984.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19318677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B21,C26,C77
`Chr7:19318800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C21
`Chr7:19318877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr7:19318947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr7:19318953`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C48
`Chr7:19318953`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C48
`Chr7:19318969`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C48
`Chr7:19318969`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C48
`Chr7:19318975`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C48
`Chr7:19318975`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C48
`Chr7:19319028`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C48
`Chr7:19319028`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773984.1

683 aa

342

683

OPT

PF03169 OPT 37-655 aa

XP_057773987.1

533 aa

266

533

OPT

PF03169 OPT 52-505 aa

XP_057773988.1

417 aa

208

417

OPT

PF03169 OPT 1-389 aa

XP_057773989.1

349 aa

174

349

OPT

PF03169 OPT 14-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773984.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	37	655	1.8e-160	536.3	OPT oligopeptide transporter protein
`XP_057773987.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	52	505	8.1e-117	392.2	OPT oligopeptide transporter protein
`XP_057773988.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	1	389	1.9e-97	328.2	OPT oligopeptide transporter protein
`XP_057773989.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	14	321	2e-78	265.4	OPT oligopeptide transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918005.1
AGTGTGGGTTCTTTTCAAATCCTTTGTTGGTAGCTTTTTGTGGGCTTTCTTCCAGTGGTTCTTCGCGGCTGCTGACGGCTGTGGTTTTAGCAGCTTCCCCACATTCGGTCTCCAAGCCTACAACCGCAGGGATGATATGTCCTTACATGGTTAACATATCATTGTTGATCGGAGCCATCCTTTCTTGGGGCATTATGTGGCCTGTGATCGAGTCCAAGAAAGGCCATTGGTACAGTGCAGACATACCGGGAAGCAGCCTT...

XM_057918001.1
TATCTTTTGCAACTGATTTTATACTTAAAATATGATGCTTAGTTGGTGATAAAATATTAACACTATACATTTGAGTTAAAAAGAATAATCAAACAGAAAAATGTGTCAAAAAATGGAAGCACAACAATTTCGGGGGGTGAGTGGAGATCCCCTAATGCTCATGCACCAACATTCATTTCATTCTCTCTCTCTCTGTATGTGTTTGTGTGTGTGTCTGCTCAACAGAAAAAGTAAAACACCTTGATCTGTAGTAGTGAGTT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130993202
ATGAGGAAAGAAAAGGAGAGTGAGGTGGAAGCCGCTGAGGGCGGCGGGGATGATCAGGCTGCCATGGAGAGGGCTTTCGAGGAGATGGCGGTGCCGCCGTGGCAGAACCAGATCACCTTCAGAGCGATGATCACCAGTCTCCTTTTGAGCATTGTGTTCAATGTCATAGTCTGCAAGCTCAATCTCTCCACCGGTGTTATTCCGTCCTTGAACGTCGCGGCGGGGCTTCTGGGTTTCGCCGCCGTCAAGGCGTGGACCGT...

LOC130993202
ATGGATGATTGGTTTCGTTTTTGTTGTGAGCTTTGTCGGCCTATTCTCAATCGTGCCGCTAAGAAGGATGATGATCTTGAAGTACAAATTGACATATCCAAGTGGGACTGCCACAGCCTACCTTATCAACAGCTTCCACACTCCCAAAGGAGCCAAGCTAGCCAAGTATATATGAAACAAGTGTGGGTTCTTTTCAAATCCTTTGTTGGTAGCTTTTTGTGGGCTTTCTTCCAGTGGTTCTTCGCGGCTGCTGACGGCTG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057773984.1
MRKEKESEVEAAEGGGDDQAAMERAFEEMAVPPWQNQITFRAMITSLLLSIVFNVIVCKLNLSTGVIPSLNVAAGLLGFAAVKAWTVMIQKCGLLKQPFTRQENTVIQTCVVASSGIAFSSGTASYLLGMSPITASQSETGNTPINVKQLSLGWMIGFVFVVSFVGLFSIVPLRRMMILKYKLTYPSGTATAYLINSFHTPKGAKLAKKQVWVLFKSFVGSFLWAFFQWFFAAADGCGFSSFPTFGLQAYNRRFYFDFSS...

XP_057773987.1
MDDWFRFCCELCRPILNRAAKKDDDLEVQIDISKWDCHSLPYQQLPHSQRSQASQVYMKQVWVLFKSFVGSFLWAFFQWFFAAADGCGFSSFPTFGLQAYNRRFYFDFSSTYVGVGMICPYMVNISLLIGAILSWGIMWPVIESKKGHWYSADIPGSSLHGIQGYRVFLAIAMILGDGLFQVVYMAILTLKSFLEQLVRRSNGVNEREEGALVEDYNERRRTDYFLKDQIPNTVAVGGYLVLALISTFVVPHIFPQLEWY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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